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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002980`

染色体: Chr04 坐标: 46213024-46225260 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002980`
名称	SmilChr04G002980
描述	DNA mismatch repair protein MLH3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46213024 - 46225260 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023776`
GeneID	`131023776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023776`
原始查询	`SmilChr04G002980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA mismatch repair protein MLH3-like
产物	DNA mismatch repair protein MLH3-like
Arabidopsis	`AT4G35520` (MLH3) MUTL protein homolog 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829704] identity=52.1; qcov=0.356; evalue=4.99e-116; confidence=low
Rice	`Os09g0551900` - identity=50.7; qcov=0.336; evalue=1.28e-101; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0006298 (mismatch repair); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0030983 (mismatched DNA binding); GO:0032300 (mismatch repair complex); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity)
KEGG	smil03430 (Mismatch repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08676 (MutL_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809341.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809341.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057809341.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809341.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46213532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B121,B46,B81,C41
`Chr4:46213847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B91,C71
`Chr4:46213853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:46215363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B124,B27,B78,B79
`Chr4:46216031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B44,C55
`Chr4:46216090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C13,C4
`Chr4:46217872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:46217880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B58,B88
`Chr4:46217938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:46218151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr4:46218325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:46218353`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A7,B21,B66,B87,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809341.1

1250 aa

625

1250

MutL_C

PF08676 MutL_C 1019-1178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809341.1`	Pfam	`PF08676`	MutL_C	Domain	1019	1178	5.7e-12	46.2	MutL C terminal dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101521.1
TGAATCACTCTCTCGGCGAGGCGGTGCTTGAGTGCAGCAGTAGTTCATCATGCAGGTAAGCTTCCAGCGACGCCATTCGTTGCGCCCTTTTTCCAGAAACCTGAAATTTAAAAATGGGGTCATTCGGAATACTTCATTCATCACAGGGAAGGGTGGCGAAGTAATTGTTTTGGAGGTGTTTTGTAAGATGAGGAGCATCGAACGGTTGCCTGAGACTACTCGCAGCTCGGTGCGTTCCGGGGTCGTGATATGTGATTTGA...

XM_057953358.1
CACTCTCTCGGCGAGGCGGTGCTTGAGTGCAGCAGTAGTTCATCATGCAGGTAAGCTTCCAGCGACGCCATTCGTTGCGCCCTTTTTCCAGAAACCTGAAATTTAAAAATGGGGTCATTCGGAATACTTCATTCATCACAGGGAAGGGTGGCGAAGTAATTGTTTTGGAGGTGTTTTGTAAGATGAGGAGCATCGAACGGTTGCCTGAGACTACTCGCAGCTCGGTGCGTTCCGGGGTCGTGATATGTGATTTGACGAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023776
ATGCAGGTAAGCTTCCAGCGACGCCATTCGTTGCGCCCTTTTTCCAGAAACCTGAAATTTAAAAATGGGGTCATTCGGAATACTTCATTCATCACAGGGAAGGGTGGCGAAGTAATTGTTTTGGAGGTGTTTTGTAAGATGAGGAGCATCGAACGGTTGCCTGAGACTACTCGCAGCTCGGTGCGTTCCGGGGTCGTGATATGTGATTTGACGAGGATTGTTGAAGAGTTAGTTTTTAACAGCCTTGATGCTGGTGCTAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809341.1
MQVSFQRRHSLRPFSRNLKFKNGVIRNTSFITGKGGEVIVLEVFCKMRSIERLPETTRSSVRSGVVICDLTRIVEELVFNSLDAGATEVSVSVGVGSSYLKVVDNGSGITRDGLVLLGERYVTSKVDHLALVDASTENLDFHGEALCSISDVALLEIVTKARGKPNGYRKILKKSKCLFLGINNDREEVGTTVITHDIFYNQPVRRKHMQSSPKKVLDSIKMSVLRIALVHVNVSFRVVDVESLDELLCVGPSSSPLPIL...

XP_057809342.1
MQVSFQRRHSLRPFSRNLKFKNGVIRNTSFITGKGGEVIVLEVFCKMRSIERLPETTRSSVRSGVVICDLTRIVEELVFNSLDAGATEVSVSVGVGSSYLKVVDNGSGITRDGLVLLGERYVTSKVDHLALVDASTENLDFHGEALCSISDVALLEIVTKARGKPNGYRKILKKSKCLFLGINNDREEVGTTVITHDIFYNQPVRRKHMQSSPKKVLDSIKMSVLRIALVHVNVSFRVVDVESLDELLCVGPSSSPLPIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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