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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003264`

染色体: Chr04 坐标: 49362361-49365000 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003264`
名称	SmilChr04G003264
描述	UDP-arabinopyranose mutase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49362361 - 49365000 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020165`
GeneID	`131020165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020165`
原始查询	`SmilChr04G003264`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-arabinopyranose mutase 1-like
产物	UDP-arabinopyranose mutase 1-like
Arabidopsis	`AT3G08900` (RGP3) reversibly glycosylated polypeptide 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820039] identity=85.8; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0599800` (OsUAM1) - identity=87.3; qcov=0.926; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005829 (cytosol); GO:0009832 (plant-type cell wall biogenesis); GO:0033356 (UDP-L-arabinose metabolic process); GO:0052691 (UDP-arabinopyranose mutase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03214 (RGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804834.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804834.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057804834.1`
4	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057804834.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49362842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C16
`Chr4:49362905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:49364264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B68,C14
`Chr4:49364285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C42,C60,D2
`Chr4:49364565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B63,C12,C53
`Chr4:49364676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804834.1

367 aa

184

367

RGP

PF03214 RGP 14-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804834.1`	Pfam	`PF03214`	RGP	Family	14	347	3e-180	599.5	Reversibly glycosylated polypeptide

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948851.1
TTGAAAATCCACGCAAATTGTATAATAAATATACAAACATGATACGGAAGTAACAACACGTAATATAATGTGATATCCAATTATAAGAATCTGATATAGAAATGGAAAAATGAATAATAAGGCAAAAAAGAGGGGTGCATCTCACATGGTAAGTCAATCCCCACTCACGCAGAAGGTAACTTGTTTCTCCACCACATCACACTTCATACCAATCTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTCCCACCACTATAAATAAAGAATCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020165
ATGTCGACGAAGCCAGCGACGAAGGTGGTGGCGCCGCTGAAAGATGAGCTGGACATCGTGATCCCGACGATCCGCAACCTGGACTTCCTGGAGATGTGGCGGCCCTTCTTCGAGCAGTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGCGACCCCTCCAAGACCATCCACGTGCCTGAGGGATTCGACTACGAGCTCTACAACCGCAACGACATCAACCGGATCTTGGGCCCCAAGGCCTCCTGCATCTCCTTCAAGGACTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804834.1
MSTKPATKVVAPLKDELDIVIPTIRNLDFLEMWRPFFEQYHLIIVQDGDPSKTIHVPEGFDYELYNRNDINRILGPKASCISFKDSACRCFGFLVSKKKYIFTIDDDCFVAKDPTGQEINALAQHIHNLLTPATPFFFNTLYDPYREGADFVRGYPFSLREGAPTAVSHGLWLNIPDYDAPTQLVKPRERNTRYVDAVLTIPKGTLFPMCGMNLAFDRELIGAAMYFGLMGDGQPIGRYDDMWAGWCTKVITDHLGLGVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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