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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003318`

染色体: Chr04 坐标: 49911775-49914924 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003318`
名称	SmilChr04G003318
描述	dihydropyrimidine dehydrogenase (NADP(+)), chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49911775 - 49914924 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020214`
GeneID	`131020214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020214`
原始查询	`SmilChr04G003318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydropyrimidine dehydrogenase (NADP(+)), chloroplastic
产物	dihydropyrimidine dehydrogenase (NADP(+))%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G17810` (PYD1) pyrimidine 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821049] identity=79; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0736400` (OsDHODH1) - identity=81.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002058 (uracil binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006210 (thymine catabolic process); GO:0006212 (uracil catabolic process); GO:0017113 (dihydropyrimidine dehydrogenase (NADP+) activity); GO:0050661 (NADP binding); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01180 (DHO_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804894.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057804894.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804894.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804894.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804894.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49912006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B91,C11,C69
`Chr4:49912175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B104,B24,C80
`Chr4:49912891`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr4:49912891`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr4:49913379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:49913649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B54,C15
`Chr4:49913802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:49914534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804894.1

419 aa

210

419

DHO_dh

PF01180 DHO_dh 44-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804894.1`	Pfam	`PF01180`	DHO_dh	Domain	44	355	9e-36	124.3	Dihydroorotate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948911.1
GTTTATTCATTATATTGTGGCGAGCACCGAAGATTTTATGTAGAGTTGTTAGAACAAAAAAAGAGAGAAAAATAAAATAATCTTGTAGATATGATCTGATCGTAATGAAATAAACATAAAGAGTCAAATCCATGTGCGTTTGAGTTGTTCCTACATGATCACTAATTGATTAATCATTATCTACACGTAATAACAATTCTTACATAATAATCGTTGAAGAATATTATATCCAAACTGTCCAATACTTTTAACTTTCTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020214
ATGGAATCTCTCAGATTTGCTACCCAGATCAGCACTCCGGTGGCCGAGTTTCCGGCAACTCGCCGCGGCCTTGGTCGAAACCGGGTCGGGTTCAGAATATCCGCGCAGGCTGAGGCTGCGGAGCCTGATCTCAGTGTGACGGTCAATGGGTTGAAGATGCCGAACCCGTTCGTCATCGGGTCGGGTCCTCCCGGCACCAACTATACTGTCATGAAGCGGGCCTTCAATGAAGGCTGGGGCGCTGTAATCGCCAAAACGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804894.1
MESLRFATQISTPVAEFPATRRGLGRNRVGFRISAQAEAAEPDLSVTVNGLKMPNPFVIGSGPPGTNYTVMKRAFNEGWGAVIAKTVSLDASKVVNVTPRYARLRAGANGSPKGQIIGWQNIELISDRPLETMLKEFKQLKEEYPDRILIASIMEEYNKAAWEELIDRVEQSGIDAFEINFSCPHGMPERKMGAAVGQDCALLEEVCGWINAKATVPVWAKMTPNITDITQPARVSLQAGCEGVAAINTIMSVMGINLDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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