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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003319`

染色体: Chr04 坐标: 49935395-49936710 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003319`
名称	SmilChr04G003319
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 9
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49935395 - 49936710 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020215`
GeneID	`131020215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020215`
原始查询	`SmilChr04G003319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 9
产物	mitogen-activated protein kinase kinase 9
Arabidopsis	`AT1G73500` (MKK9) MAP kinase kinase 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843685] identity=64.4; qcov=0.978; evalue=4.58e-141; confidence=high
Rice	`Os06g0191300` (OsMKK5) - identity=46.9; qcov=1.01; evalue=2.75e-102; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804895.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804895.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804895.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804895.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49935650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:49935758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:49935830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C50
`Chr4:49935926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:49936079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:49936223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B125,B90,B92,C87
`Chr4:49936316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,C87
`Chr4:49936394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:49936406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B55,B81,C21,C6
`Chr4:49936474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804895.1

322 aa

161

322

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 53-309 aa PF00069 Pkinase 53-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804895.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	53	309	1.9e-39	136.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057804895.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	53	314	5.4e-67	226.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948912.1
AGCCTTCCAAGCCCCTTCCGCCCGCCATCGCACGTGCTTCACTTATATACACCCTCACTCTCCACCTCTTCATCTCTCCACCTCAATCTTATCCTACTCCCCCCCCCCCCCCCTGCGCACGTTATCCTATGGCCGTCGTCCGCGATCGCCGTCAGCTCAACCTCCGCCTCCCTCTACCTGAACCCTCCGAACGCTGCTCCCGCTTCCCACCCCCTCTCCCCCCCTCCGCCGCGGCTGCCGCTGCCGCCGCCCCCTCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020215
ATGGCCGTCGTCCGCGATCGCCGTCAGCTCAACCTCCGCCTCCCTCTACCTGAACCCTCCGAACGCTGCTCCCGCTTCCCACCCCCTCTCCCCCCCTCCGCCGCGGCTGCCGCTGCCGCCGCCCCCTCCGCCACCGCCATAACCGCTGCCGACCTCGAGAAGCTCCAGGTCCTCGGGCATGGAAACGGCGGAACCGTCTACAAAGTCCGGCACAAGCAGACGTCCGCCACCTACGCCCTGAAGGTCGTCCACGGCGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804895.1
MAVVRDRRQLNLRLPLPEPSERCSRFPPPLPPSAAAAAAAAPSATAITAADLEKLQVLGHGNGGTVYKVRHKQTSATYALKVVHGDSDPAVRRQVLREVSILRRTDSPHVIKCHGVFDLPGGDIAFCMQYMDMGTLETLLKNDVVFTETLLARICRQILSGLEYLHSHKIIHRDLKPSNILVNQKMEIKISDFGVSKILQRTLDPCNSYVGTCAYMSPERFDPDTYRSNNYDVYAGDIWSLGLTLLELYVGHFPYLAPGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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