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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003335`

染色体: Chr04 坐标: 50031945-50034256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003335`
名称	SmilChr04G003335
描述	purple acid phosphatase 4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50031945 - 50034256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020233`
GeneID	`131020233`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020233`
原始查询	`SmilChr04G003335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 4-like
产物	purple acid phosphatase 4-like
Arabidopsis	`AT1G14700` (PAP3) purple acid phosphatase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838035] identity=57.6; qcov=0.841; evalue=1.86e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0238600` (OsPAP3c) - identity=56.5; qcov=0.814; evalue=2.93e-122; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020233

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057804918.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057804918.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804918.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804918.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50032226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C78
`Chr4:50032811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A7,B30,B35,C23
`Chr4:50033140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50033623`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr4:50033623`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr4:50033679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A2,A20,A22,A25,B101,B104,B121,B124,B125,B126,B128,B132,B134,B135,B136,B22,B24,B29,B33,B36,B38,B39,B4,B44,B55,B58,B61,B62,B69,B77,B80,C11,C12,C13,C18,C22,C24,C29,C30,C38,C41,C42,C49,C5,C69,C7,C72,C73,C76,C82,D2,D7,D8,D9
`Chr4:50033750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804918.1

370 aa

185

370

Metallophos

PF00149 Metallophos 80-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804918.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	80	288	2.5e-20	74.5	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948935.1
ACCAGCAAAAATAATAGCGTTATGTAAAAAGTGGGGTGGAAGATTTGAAATTTGAAAGGTGATGAAGTAAACCCACGTATGAGTGCCCATATATACCTCATAAATCTCAAATTACACAACATTTTCATATATTTTGAGGCCTCGATTATCTACAGAGTTTGGGCATGCACGTAGCTCAGCAGAAACGTATATCCCAACACCTATTGCTTCATCTGGAAAATAATTATTTCAAATAAGGAAAATCAAATTACTAATAGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020233
ATGCCTTTTTGTCTTAACTGCATCCATTTTGATGAGCTTTTGGTGCCTATATATATACACACACTCCTGTTACATAATGTACGAATAAGTCATCCCATTATGTCTCATTTGTTTTATAACTCCTTATTGATATGGCCACTATTGCTGATGACGTCCTTCTCACTGAAACTTCCAAGCAAAGCTGTGGAACTTTCCAGAATCCAGCATCTGAGCAAGAGAGACGACCATTCTATCGCGTTTTTGGTTGTGGGAGATTGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804918.1
MPFCLNCIHFDELLVPIYIHTLLLHNVRISHPIMSHLFYNSLLIWPLLLMTSFSLKLPSKAVELSRIQHLSKRDDHSIAFLVVGDWGRDGNFNQSRVATQMGNVGKKLGIDFVISTGDNFYTKGLKGVDDRAFQTSFTNIYTAKSLRKPWYSVLGNHDYQGNVEAQLSPALKKLDRRWNCKRNFIVEAGAADIFFVDTTPFVQKYFDNPKKQEFDWRNVFPRERYLSSTLKNLNLSLENSKARWKIVVGHHTIRSIGYHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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