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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003406`

染色体: Chr04 坐标: 50622546-50627775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003406`
名称	SmilChr04G003406
描述	hexosyltransferase GAUT11-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50622546 - 50627775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020290`
GeneID	`131020290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020290`
原始查询	`SmilChr04G003406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hexosyltransferase GAUT11-like
产物	hexosyltransferase GAUT11-like
Arabidopsis	`AT1G18580` (GAUT11) galacturonosyltransferase 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838439] identity=75.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0413400` - identity=63.5; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0047262 (polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF25557 (GAUT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804998.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057804998.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057804998.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804998.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50623471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50623691`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:50623691`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr4:50623956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50624031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50624244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50624247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804998.1

536 aa

268

536

GAUT_1

Glyco_transf_8

PF25557 GAUT_1 79-124 aa PF01501 Glyco_transf_8 234-509 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804998.1`	Pfam	`PF25557`	GAUT_1	Domain	79	124	3.1e-07	31.3	Galacturonosyltransferase domain 1
`XP_057804998.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	234	509	1.3e-72	245.1	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949015.1
AGTAAAGAAAATACGAATATCATTTTCCGTTATAAAATACTACTATCTTCAAATAATCAAGAAACAAATACAACAGAAAAATCGATCAAATCAAAAGGTAAAGACTGTGTAGGAAACTCCAAAAACTGTGCAGATCCCTCCATCTAATCTTCATTAGATTTACCCAAAATCGATCCCTCTTTGATTTATGAACAAAACTAGAAATGCCAACTCACCCAAAATTGCTTCTTTGCCAATGACACACACACTTACTCACTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020290
ATGCGCCGTCGGGCGACCGACTTTCGGCGCCCGGTTAGGAGGAGGTTTTCGTGCTGGATCTGGGTGCTGCTTCTCTTGTTCTTGATTGCAGGTTTTGGGTTGTTTGTTGTTCAGCATAATCATCGAGATGAGGATCATGTGGAACAACCTCTTCTGGAGATAAACCCACGAATAGACAGGGCTGTTCATGAGAACCGAAATTTTACTGAAGAAATATTGAGTGCGAGATCATATGCCCGACAGTTAGCAGAGCAAATGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804998.1
MRRRATDFRRPVRRRFSCWIWVLLLLFLIAGFGLFVVQHNHRDEDHVEQPLLEINPRIDRAVHENRNFTEEILSARSYARQLAEQMTLAKAYVIIAKEHNNLHLAWELSTKIRSCQLLLSKAAKREEPISLEEAEPIIKSLSFLIFKAQDAHYDIATTMMTMKSHIQALEERANAATVQSTVFGELAAESIPKNLQCVDIKLTANWLQNKSIEELANERRNSPRLVDNNLYHFCIFSDNLLAVSVVVNSTISNAEHPKQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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