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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003546`

染色体: Chr04 坐标: 51811688-51817876 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003546`
名称	SmilChr04G003546
描述	peroxisomal ATPase PEX6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51811688 - 51817876 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020429`
GeneID	`131020429`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020429`
原始查询	`SmilChr04G003546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal ATPase PEX6
产物	peroxisomal ATPase PEX6
Arabidopsis	`AT1G03000` (PEX6) peroxin 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839315] identity=62.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0617600` - identity=53.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0005829 (cytosol); GO:0016558 (protein import into peroxisome matrix); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00004 (AAA); PF17862 (AAA_lid_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020429

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057805197.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805197.1`
3	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057805197.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805197.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51814427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr4:51814444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:51814526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B22
`Chr4:51814876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:51815816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:51816235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B120,B7,D4,D7
`Chr4:51816317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr4:51816500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr4:51816530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:51816598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B120,B7,D4,D7
`Chr4:51816638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B66,B96,C33
`Chr4:51816675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805197.1

934 aa

467

934

AAA

AAA_lid_3

PF00004 AAA 375-529 aa PF00004 AAA 689-821 aa PF17862 AAA_lid_3 845-885 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805197.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	375	529	8.2e-60	201.7	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057805197.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	689	821	8.2e-60	201.7	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057805197.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	845	885	6.9e-09	35.8	AAA+ lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100689.1
ATTATGGTCCCAAAATATACCAAGTGACAGTGGAAGTTAAAAACGGTTATAGCCCAAATCAACCACTTGGTGACCATCTCGAGTTGCTCAACGTACAGCTCTCTTTCACTACATCCAATCCAATCTATACAAAAACACAGTTGTATCTATCACCTCCACCAATAACATTTTCCATTTTTTTCATTGAATAATTAATGGTTAGTTCTGGTCGATTGAAGAGGGTTTAGGGTTTTTGTGAATTGTGCGGCAATGGTGGAGAG...

XM_057949214.1
TGGTCCCAAAATATACCAAGTGACAGTGGAAGTTAAAAACGGTTATAGCCCAAATCAACCACTTGGTGACCATCTCGAGTTGCTCAACGTACAGCTCTCTTTCACTACATCCAATCCAATCTATACAAAAACACAGTTGTATCTATCACCTCCACCAATAACATTTTCCATTTTTTTCATTGAATAATTAATGGTTAGTTCTGGTCGATTGAAGAGGGTTTAGGGTTTTTGTGAATTGTGCGGCAATGGTGGAGAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020429
ATGGTGGAGAGGAGGAAGAGGAAGCCCCTTGTGCTTTCTTCAACTAAGGTCCTCGTTGATTCTTTGCTCAATTCTCACAGAACAGCTGAAGATGGTGATGGAATTGACGAGATTGACCCCGGTCCTTCCGCCCGCACGCTGCAGCTCACGGCTGGGATTCTCAGAGTTTCCGACGACTCAATTCTTAATTCAGTTGATGGCTCTGTTTCGATTGGGTTGTCCACTGCTGTTCTCAAAAAATTATCCATTACATCAGGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805197.1
MVERRKRKPLVLSSTKVLVDSLLNSHRTAEDGDGIDEIDPGPSARTLQLTAGILRVSDDSILNSVDGSVSIGLSTAVLKKLSITSGSLVLINNIDANVSRIGQAVVLDPPNPDDSSQVQGSVISHAPKTMLIFPSYTYPQTQPESLGYQVAYVSPILAFNLCLHQSCLKNIVQQGREKLSSLFEIEANDEINEKENKTFSVCIGLEPWAKTPKYASHLRASFVKIPECGTLEHLKSGSSEEAKDRQSLIDLALNDYFSVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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