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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003599`

染色体: Chr04 坐标: 52428092-52430533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003599`
名称	SmilChr04G003599
描述	phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52428092 - 52430533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020476`
GeneID	`131020476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020476`
原始查询	`SmilChr04G003599`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
产物	phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
Arabidopsis	`AT2G34980` (SETH1) phosphatidylinositolglycan synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818062] identity=68.8; qcov=1; evalue=4.12e-128; confidence=high
Rice	`Os02g0622200` - identity=69.2; qcov=0.987; evalue=1.24e-149; confidence=high
GO	GO:0000506 (glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06432 (GPI2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805280.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805280.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057805280.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805280.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52429537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:52429580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B122,C32,C68
`Chr4:52429621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B113,C42
`Chr4:52429666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:52429772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr4:52429905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B66,B75,C74
`Chr4:52429906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B122,C32,C68
`Chr4:52429951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B88
`Chr4:52430152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805280.1

303 aa

152

303

GPI2

PF06432 GPI2 16-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805280.1`	Pfam	`PF06432`	GPI2	Family	16	293	6.1e-77	259.6	Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949297.1
AAAGAAAACAATTTAAAACAAGCCCAACACTTTTCTCTTCTCATTCACAATCACAATCACAATCACAATCACGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATATTGTCTGCATCCTCCCAAAACCAATCCCCATACTTCTCCCAAGGAAATCCCCATTTTCTTCTCACAAAATCAAATCCGTAACTCGCACTCCCCTCCTTTTCTTCTCCAGCGAGAATTCGCCGTTCGACCACCCAATATCGCCGCCGCCTTATCATTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020476
ATGGAATCCCACTTGCATAAGAGTTCGTCTCCAACCATTCAAAAATGGAGGAAAGTTGCCTATGGCGGGATGCAACCCGGGTTTGATGACAATCATACAGATGAGTCTTTCCTAGAAGACATGATTATGAACGCCAATGTTGTGAAAAGAGATCTGGTTAAGGTGATTCTTGACGCAGTTTCCATCTCACAATATTTGTGTGTTGTTGCTCTTGTTGTCTTGGTCTGGACTTATACACTTAGATCCATCTTTAGCGAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805280.1
MESHLHKSSSPTIQKWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDMIMNANVVKRDLVKVILDAVSISQYLCVVALVVLVWTYTLRSIFSEQSLLLLDIALLGWGFLVVLLTAETLSFELLLNYILRTSFFITGLYILSPIYHTLTRSISSDSIWALTAALVILHLFLHNYSGSTVEAPGALEFSTFTSNISLNVSIVASLLIASRLPSRLHVFAIVLFSLQVFLFAPFVSYCIKKYSFRLHLCFSLGLMALTLFFVYHLHQLLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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