当前解析结果
SmilChr04G003664| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003664 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003664 |
| 描述 | adenosine kinase 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 53090879 - 53094025 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020539 |
|---|---|
| GeneID | 131020539 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020539 |
| 原始查询 | SmilChr04G003664 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | adenosine kinase 2 |
| 产物 | adenosine kinase 2 |
| Arabidopsis | AT5G03300 (ADK2)adenosine kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831882] identity=84.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0625500- identity=81.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004001 (adenosine kinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006166 (purine ribonucleoside salvage) |
| KEGG | smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00294 (PfkB) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020539 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057805410.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057805410.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057805410.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805410.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805410.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:53091145 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,B85 |
Chr4:53091200 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B18,B22,C74 |
Chr4:53091217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B29,C14 |
Chr4:53091350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C80 |
Chr4:53091417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr4:53091418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,B57,B79 |
Chr4:53091428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,B63,B71,B85 |
Chr4:53091444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B8,B88,C67 |
Chr4:53091696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr4:53091708 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr4:53092001 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr4:53092125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B29,C14 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805410.1PF00294
PfkB 27-334 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805410.1 |
Pfam | PF00294 |
PfkB | Domain | 27 | 334 | 3.5e-71 | 240.7 | pfkB family carbohydrate kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。