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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003688`

染色体: Chr04 坐标: 53284070-53288558 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003688`
名称	SmilChr04G003688
描述	dnaJ protein P58IPK homolog B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53284070 - 53288558 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023615`
GeneID	`131023615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023615`
原始查询	`SmilChr04G003688`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein P58IPK homolog B-like
产物	dnaJ protein P58IPK homolog B-like
Arabidopsis	`AT5G03160` (P58IPK) DnaJ P58IPK-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831917] identity=71.9; qcov=0.907; evalue=1.38e-169; confidence=high
Rice	`Os02g0195300` (OsDjC16) - identity=71.2; qcov=0.909; evalue=9.84e-176; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00515 (TPR_1); PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809139.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809139.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809139.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809139.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53284435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B59
`Chr4:53285059`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A18,B1,B111,B114,B117,B118,B127,B137,B14,B140,B17,B23,B25,B26,B3,B37,B42,B43,B47,B55,B6,B7,B78,B84,B94,C18,C22,C3,C51,C62,C63,C71,C75,C8,C81,C82,D11,D3,D5
`Chr4:53285082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,C82
`Chr4:53285686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:53285981`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B88,C70
`Chr4:53285981`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B88,C70
`Chr4:53288503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C53,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809139.1

408 aa

204

408

TPR_16

TPR_1

TPR_8

DnaJ

PF13432 TPR_16 73-121 aa PF00515 TPR_1 132-164 aa PF13181 TPR_8 132-164 aa PF00226 DnaJ 303-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809139.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	73	121	2.2e-14	54.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057809139.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	132	164	1e-17	63.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057809139.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	132	164	1.1e-09	38.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057809139.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	303	366	1.7e-26	92.8	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953156.1
ATGTCTGCTCTTGTTACTGCTGTTGCGTTTTTCAGGGACTTCTTTCCACATTCAGGGGTAAGTTTTCCAGGGACTTCTTTCCACATTCAGGGATATGGGGAATCTGAGGAAAGCTACAGAAAGTTTCTGGAGATGAAACCTGGCAATTCAGCAGCAGAGAAGGAGCTTTCTAAGTTACATCAAGCTCAGAGTGGTTTGGATTCCACTAAAGTAGTTTTTGAATCTGGTGACTATATGAAAGCACTGGAATATCTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023615
ATGTCTGCTCTTGTTACTGCTGTTGCGTTTTTCAGGGACTTCTTTCCACATTCAGGGGTAAGTTTTCCAGGGACTTCTTTCCACATTCAGGGATATGGGGAATCTGAGGAAAGCTACAGAAAGTTTCTGGAGATGAAACCTGGCAATTCAGCAGCAGAGAAGGAGCTTTCTAAGTTACATCAAGCTCAGAGTGGTTTGGATTCCACTAAAGTAGTTTTTGAATCTGGTGACTATATGAAAGCACTGGAATATCTTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809139.1
MSALVTAVAFFRDFFPHSGVSFPGTSFHIQGYGESEESYRKFLEMKPGNSAAEKELSKLHQAQSGLDSTKVVFESGDYMKALEYLEKVVLVFSPECSKAKLLKVRLLIAAKDYSSAISETGYILKEDEDNLEALLLRGNAYYYLVDHDIAIRHYQKGLRLDPEHGELKRSYFGLKKLLKNTISADDNASNGKLRLATEEYKAALALDPIHSAHNVHLYLGLCKVQVKLGRGDDAVTSCTEALEIDGDLVEALVQRGEAKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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