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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003745`

染色体: Chr04 坐标: 53747754-53748552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003745`
名称	SmilChr04G003745
描述	zinc finger protein ZAT9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53747754 - 53748552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023619`
GeneID	`131023619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023619`
原始查询	`SmilChr04G003745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT9-like
产物	zinc finger protein ZAT9-like
Arabidopsis	`AT3G60580` (AT3G60580) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825229] identity=38.6; qcov=1.19; evalue=1.9e-50; confidence=medium
Rice	`Os04g0552700` - identity=34.4; qcov=1.26; evalue=2.76e-35; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF13894 (zf-C2H2_4); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809144.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809144.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809144.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809144.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53747914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:53748121`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	147	A1,A11,A13,A15,A18,A19,A2,A22,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B102,B104,B106,B108,B111,B112,B113,B114,B118,B119,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B13,B131,B132,B136,B137,B14,B140,B15,B17,B2,B22,B24,B25,B28,B31,B32,B35,B40,B41,B44,B45,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B67,B69,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B90,B95,B96,B97,C1,C11,C14,C15,C20,C21,C24,C27,C28,C3,C31,C32,C35,C36,C37,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr4:53748125`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	157	A1,A11,A13,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A24,A3,A5,A8,B1,B102,B104,B106,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B129,B13,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B2,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B3,B31,B32,B35,B36,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B61,B62,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B90,B95,B97,C1,C11,C14,C15,C17,C20,C21,C24,C27,C28,C3,C31,C32,C35,C36,C37,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C65,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr4:53748293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr4:53748402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:53748456`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A6,B112,B114,B14,B21,B25,B5,B54,B56,B75,B80,B83,B96,C17,C20,C51,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809144.1

240 aa

120

240

zf-C2H2_6

zf-C2H2_4

PF13912 zf-C2H2_6 3-26 aa PF13912 zf-C2H2_6 133-157 aa PF13912 zf-C2H2_6 185-208 aa PF13894 zf-C2H2_4 186-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809144.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	3	26	5.6e-26	90.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057809144.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	133	157	5.6e-26	90.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057809144.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	185	208	5.6e-26	90.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057809144.1`	Pfam	`PF13894`	zf-C2H2_4	Domain	186	208	4.8e-13	49.3	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953161.1
ATGGAGAGGCACAGATGCAAAGTTTGCTTCAGAAATTTCGGTGATGGAAGAGCTCTAGGTGGCCACATGAGATCTCACTCCATGAATTCCTCCAAACAAGTCGAGGAAACGCACTCGTGTTCCTCGTCGCGAGGCGAAGTCGTCGAGAATCGAGAAGACGGCGAGACGGCGCCGTCGTCGAAAATTAGGGCAAGAGAAATTACTAATTACGAGGAGCGATCGCCGTTGAGTTCGGTTTCGGACACGGCTACCGAAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023619
ATGGAGAGGCACAGATGCAAAGTTTGCTTCAGAAATTTCGGTGATGGAAGAGCTCTAGGTGGCCACATGAGATCTCACTCCATGAATTCCTCCAAACAAGTCGAGGAAACGCACTCGTGTTCCTCGTCGCGAGGCGAAGTCGTCGAGAATCGAGAAGACGGCGAGACGGCGCCGTCGTCGAAAATTAGGGCAAGAGAAATTACTAATTACGAGGAGCGATCGCCGTTGAGTTCGGTTTCGGACACGGCTACCGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809144.1
MERHRCKVCFRNFGDGRALGGHMRSHSMNSSKQVEETHSCSSSRGEVVENREDGETAPSSKIRAREITNYEERSPLSSVSDTATEEDVARCLMMLSRDRWERRNENDDDDDDDEEDSGHLRKAKGLRWIRGKYKCEKCNKLFKSYQALGGHRASYNKKIKTDVAARFSSGPAAAAAAAAAVEEKVHECPFCDRVFASGQALGGHKRSHFRGASSVRIISRIGENLDIDLNLPAPVDDGEQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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