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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003856`

染色体: Chr04 坐标: 54511952-54514583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003856`
名称	SmilChr04G003856
描述	voltage-dependent chloride channel 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54511952 - 54514583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020680`
GeneID	`131020680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020680`
原始查询	`SmilChr04G003856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	voltage-dependent chloride channel 2, chloroplastic
产物	voltage-dependent chloride channel 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G61320` (AT3G61320) Bestrophin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825304] identity=63.4; qcov=0.926; evalue=4.1e-170; confidence=high
Rice	`Os03g0106000` - identity=60.6; qcov=0.926; evalue=5.08e-141; confidence=high
GO	GO:0005247 (voltage-gated chloride channel activity); GO:0042548 (regulation of photosynthesis, light reaction)
KEGG	-
Pfam	PF25539 (Bestrophin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805638.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057805638.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057805638.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057805638.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54512110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:54512152`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B107
`Chr4:54512152`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B107
`Chr4:54512194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54512344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B65,B72,C71
`Chr4:54512476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B1,B49,C39
`Chr4:54512488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C2,C55
`Chr4:54512553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr4:54512590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B46
`Chr4:54513696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B16,B19,B37
`Chr4:54514080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B107,B7,C16,C33
`Chr4:54514267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C14,C16,C45,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805638.1

419 aa

210

419

Bestrophin_2

PF25539 Bestrophin_2 92-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805638.1`	Pfam	`PF25539`	Bestrophin_2	Family	92	379	1.5e-85	287.9	Bacterial/Fungal Bestrophin protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949655.1
ATCTTTCACTACAAACCAAAAGCATGTTGTCATGTGTAGGAACCTGAGTCACACATGTTAATGTTAGCACCTCTTTGAGTTCATGCACCACAATCCAATTTCTCCTTCTCTCCTAAAACCTCCCATTTTTCTCTGCAATCTCCAATGTCAATTCCTCACTCTGCGAAGCTACCATCTCCATCTCCTTCTCCTTCTCCCCCCAAAATGCTCTCCAAATTCCCCCACGCGCCGCTCCTCAATCCCTCCACCAACCGATCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020680
ATGTCAATTCCTCACTCTGCGAAGCTACCATCTCCATCTCCTTCTCCTTCTCCCCCCAAAATGCTCTCCAAATTCCCCCACGCGCCGCTCCTCAATCCCTCCACCAACCGATCCCCCAAATCCCTCTGCGCCTGCCACTCCACTAAACCCTCCAACTCGCCCCCAATTCGCGATTCCGCCCTCGCCTCCATCCTCCTCGCCATCCCCGACTGGGCCGACGCCATCAAGGAGAGAGGCATGAAGCAGAGGCGCTACCTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805638.1
MSIPHSAKLPSPSPSPSPPKMLSKFPHAPLLNPSTNRSPKSLCACHSTKPSNSPPIRDSALASILLAIPDWADAIKERGMKQRRYLYDHQSWVQHRSSLRHVRHLLTSLSSRVILSLVPPVIAFTSVAVFVAVYNSAVSMDLLPEFFPILRASSLPYQLTAPALALLLVFRTEASYSRFEEGKKTWTKVISGAEDFARQLTANVHAPDDDTLKKAILQYLMAFPVALKCHIINGSDVAQDLNNLLDGDDLAVVLSSKHRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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