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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003880`

染色体: Chr04 坐标: 54657064-54660847 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003880`
名称	SmilChr04G003880
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54657064 - 54660847 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020666`
GeneID	`131020666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020666`
原始查询	`SmilChr04G003880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
产物	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
Arabidopsis	`AT1G01540` (AT1G01540) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839533] identity=73.3; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0125600` - identity=62.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805620.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805620.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805620.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805620.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54657492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:54657506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C14
`Chr4:54657528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B130,B63,C53
`Chr4:54657605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:54657633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54657650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,C13,C48,C77
`Chr4:54657654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr4:54657677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B41
`Chr4:54657690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B110,C10
`Chr4:54657710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C73,C74,C83
`Chr4:54657738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B48,B98,D7
`Chr4:54658269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B3,C12,C16,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805620.1

500 aa

250

500

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 174-440 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 174-441 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805620.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	174	440	6.1e-46	157.7	Protein kinase domain
`XP_057805620.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	174	441	1.4e-45	156.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949637.1
ACGCTTTTTCTTTTACACAGTGAGAATTACACTCGGACACACACACACACACACACACTTCAAGTACAGTAGAGCTATAGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACAGAAGCTCGCCGGCGAATAACTTTCACCGGCGGGAGGTTTTCCGAATTCAATTCGATATCATTTCCGCCAAATCTCTCCACGAGAGAAGAATTCAATTCAAAATCATTCTCAACAGACACACACAGACGTATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020666
ATGTCGGTGTACGATGCGACGTTTGTGAACACGGAGCTGTCGAAGAAGACCTCGATCTTCGGCCTTCACCTGTGGGTGGTGATCGGGATAGTCGTCGGAGCAGTCATTGTGTTAATTCTCTTTCTATTGTCTCTCTGCATCACCGCATCGCGCCGCCGAAGCAGCGGCAAGGGTAAAGGCAGCCGGCCGGTGAAGCTCTCCGGCGGCGCCGAGATTACTCCCGTCGTGTCCAAGGAAATCCAGGAGATCTTCCACGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805620.1
MSVYDATFVNTELSKKTSIFGLHLWVVIGIVVGAVIVLILFLLSLCITASRRRSSGKGKGSRPVKLSGGAEITPVVSKEIQEIFHETSVSAAADHRPIGTQAAPEIQIDMGKVEHRVVFSDRGASSGESRATSGADTVSFGGGSGSLPEVSHLGWGRWYTLRELEAASNGLADENVIGEGGYGIVYYGVLADNTKIAIKNLLNNRGQAEKEFKVEVEAIGRVRHKNLVRLFGYCVEGAYRMLVYEYVDNGNLDQWLHGDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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