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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004085`

染色体: Chr04 坐标: 55887282-55891077 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004085`
名称	SmilChr04G004085
描述	inactive beta-amylase 9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55887282 - 55891077 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020958`
GeneID	`131020958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020958`
原始查询	`SmilChr04G004085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive beta-amylase 9-like
产物	inactive beta-amylase 9-like
Arabidopsis	`AT5G18670` (BMY3) beta-amylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831985] identity=52.3; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0667100` (OsSTA201) - identity=48.1; qcov=0.81; evalue=1.32e-142; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805997.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057805997.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805997.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805997.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55887564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:55887642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B3,C15,C64,C66
`Chr4:55887651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B104,B35
`Chr4:55887676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B122,B124,D11
`Chr4:55887683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B35
`Chr4:55887713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B104,B35
`Chr4:55887743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B38,B39,B55,C75
`Chr4:55887744`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr4:55887744`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr4:55887770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B122,B124
`Chr4:55887838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55887881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B12,C61,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805997.1

531 aa

266

531

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 96-496 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805997.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	96	496	3.3e-89	300.5	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950014.1
TAAATGTTTTTTTTTCAGTACATGTCATATGTGTCTCCACGTTTTCTTATCCACAAAAATATCCTGTGATCGCAAATTAATTGGGATTCTGCATGTCGGAAAAGGGAAATAGAAAAATAATAAATCAAACTCATTTATATTGAAAAGCAATCTTATCCCAAATCAAGGCCATTACCCTTTCTTTTTTTTCGTTTAATTCCGGGGTTTAACGGTGAAAAAAATTGTTTTTTTTTTATAGATTACAAAAAAAAAAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020958
ATGGAGATTTCAGCTATTCGAAGCTCACAGGTGAATTTAGGAAGAAGTTTTGATGCTGGGCTGTTTAGTTTTAGCAAGAATTTGGGTGCCAAAATCTGCAATTTGAAGAACAATAATCCGAAAACGTGCTGCTTCATTCACAATCAAAGCTTGAAATGGCCTTCGAAATCTGCTGTGGGTTTCACTCTCAGAGCCTCTGCTGCTGCTCAAATTGCAGATGCTGTCAATTCTGAGAAAGCTCCAATAATTTCAAGAACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805997.1
MEISAIRSSQVNLGRSFDAGLFSFSKNLGAKICNLKNNNPKTCCFIHNQSLKWPSKSAVGFTLRASAAAQIADAVNSEKAPIISRTKHEVDGIKLFVGLPLDTVSKSNKINRARAIAAGLKALKALGVNGVELPIWWGVAEREAMGKYEWTSYLAVVDMVQKLGLELHVSLCFHASEECGIRLPEWVSRIGEGDPDIYFSDRLGQQYKDCLSFAVGDIPVLDGKTPVQVYKEFCDDFKATFSPFLGSTITSVTIGLGPDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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