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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004160`

染色体: Chr04 坐标: 56287036-56288624 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004160`
名称	SmilChr04G004160
描述	probable WRKY transcription factor 48
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56287036 - 56288624 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021042`
GeneID	`131021042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021042`
原始查询	`SmilChr04G004160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 48
产物	probable WRKY transcription factor 48
Arabidopsis	`AT5G49520` (WRKY48) WRKY DNA-binding protein 48 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835012] identity=52; qcov=0.779; evalue=2.76e-56; confidence=high
Rice	`Os03g0758000` (OsWRKY3) - identity=80; qcov=0.245; evalue=4.41e-43; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806105.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806105.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806105.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806105.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806105.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56287344`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr4:56287344`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr4:56287385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:56287428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C71,C84,D4
`Chr4:56287847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:56287948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D11
`Chr4:56288053`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr4:56288053`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84
`Chr4:56288056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:56288116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:56288137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr4:56288206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806105.1

326 aa

163

326

WRKY

PF03106 WRKY 157-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806105.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	157	214	4.9e-27	94.6	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950122.1
GTCCGAACCCCCCACCCCCCCACCCCCCACCACGAAAAGAGAGAGAGGAGGCCCCTAGCTTCACAAAGTCTCTCTTCACTTCACACTTCAAAACCCCCAAAACCAACACACAAAGCTCTCTCTCTCTAAATTGCTTCACTGTAGAAGAACAGCAGCGAATGAAGAATCTACACTTTTAATCAAGGAGAATTGATGGAGGAGAAGCAAAAGGAGTCTGGAGATGAAAAGATTGCATTTTCCGATCAGATGATGATTCCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021042
ATGGAGGAGAAGCAAAAGGAGTCTGGAGATGAAAAGATTGCATTTTCCGATCAGATGATGATTCCAGAAAGCAGCAGCGGCAGCGGCTTCTTCGACCTATCATCAACAACCGATCATCACCACAAAACCAATTCTTTCAGATTCGTAGACATGTTGAGCGTCCAAGATTTCACCAACCCTTCTTCCATCTTCGACGATTTGCTGCACACCATCACCGCCCCCTTCCCCCCGCCGCCGGAATATTCCGAGGTCGTCAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806105.1
MEEKQKESGDEKIAFSDQMMIPESSSGSGFFDLSSTTDHHHKTNSFRFVDMLSVQDFTNPSSIFDDLLHTITAPFPPPPEYSEVVNTPATPNSSSVSSSSTEAAAANDDHKRIDEEEEEQDQEKTRKLQLKPKKKNQKRQREPRFAFMTKSEIDNLDDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTSTACGVKKRVERSCEDPTIVVTTYEGTHAHPCPLTPRGSFAVMPERGAMLDGGMLHRYHHQLTPPQPMQHQPYFHNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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