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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000038`

染色体: Chr05 坐标: 171725-174936 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000038`
名称	SmilChr05G000038
描述	organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	171725 - 174936 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026525`
GeneID	`131026525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026525`
原始查询	`SmilChr05G000038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic
产物	organelle RRM domain-containing protein 6%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G73530` (AT1G73530) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843687] identity=58.8; qcov=0.548; evalue=1.68e-39; confidence=medium
Rice	`Os07g0549800` (P0534A03.127) - identity=57.7; qcov=0.441; evalue=4.9e-28; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0016554 (cytidine to uridine editing); GO:1900871 (chloroplast mRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812387.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057812387.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812387.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:171792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:171803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:171815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B129,B78
`Chr5:171844`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A22,A5,B10,B108,B119,B12,B135,B25,B32,B35,B36,B46,B5,B65,B67,B77,B84,C23,C35,C36,C49,C50,C54,C73,C78,C82,C85,D7
`Chr5:171847`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A22,A5,B10,B108,B119,B12,B135,B25,B32,B35,B36,B46,B5,B65,B67,B77,B84,C23,C35,C36,C49,C50,C54,C73,C78,C82,C85,D7
`Chr5:171865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B129,B78
`Chr5:171931`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr5:171931`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr5:172896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:173120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C85
`Chr5:173165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B140,C72,D10
`Chr5:173695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812387.1

177 aa

177

RRM_1

PF00076 RRM_1 84-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812387.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	84	153	8.6e-20	71.1	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102332.1
CAAAAAAAATTGACTCAATTTTACAGTCGCACAAAGAGAAGATTAGCTGGAGAAGATGGCAGCTCCCGCCCTCAACCACCGCATTCCGCCGCGCCGGTTTCTCACACCACCGACGAATCCGCCGGTAGCTTCAGTTACAACGGTAGTGTTTGAATCGAAAAGACGGTTTCATCCCCCACTCCCCTCTCTGTTATCCATCCACAACAACTTTCCCCCAAAATTTAATTTCAGCGTAGCTTCATGCCTTGATTCTTCTTCAT...

XM_057956404.1
AAACTACTTCAAAAAAAATTGACTCAATTTTACAGTCGCACAAAGAGAAGATTAGCTGGAGAAGATGGCAGCTCCCGCCCTCAACCACCGCATTCCGCCGCGCCGGTTTCTCACACCACCGACGAATCCGCCGGTAGCTTCAGTTACAACGGTAGTGTTTGAATCGAAAAGACGGTTTCATCCCCCACTCCCCTCTCTGTTATCCATCCACAACAACTTTCCCCCAAAATTTAATTTCAGCGTAGCTTCATGCCTTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026525
ATGGCAGCTCCCGCCCTCAACCACCGCATTCCGCCGCGCCGGTTTCTCACACCACCGACGAATCCGCCGGTAGCTTCAGTTACAACGGTAGTGTTTGAATCGAAAAGACGGTTTCATCCCCCACTCCCCTCTCTGTTATCCATCCACAACAACTTTCCCCCAAAATTTAATTTCAGCGTAGCTTCATGCCTTGATTCTTCTTCATCTTCTTCGTCTACACCAAGAACTAGATTGAATCCATCTACAAGGCTATTCGTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812387.1
MAAPALNHRIPPRRFLTPPTNPPVASVTTVVFESKRRFHPPLPSLLSIHNNFPPKFNFSVASCLDSSSSSSSTPRTRLNPSTRLFVSGLSFRTTEEGLRNAFKNFGELVEVKLVMDRIANRPRGFAFIKYKTEEESKKAIEGMHGKFLDGRVIFVETAKSRAELGQETTKQQNPRQR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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