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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000202`

染色体: Chr05 坐标: 1606595-1610064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000202`
名称	SmilChr05G000202
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1606595 - 1610064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026621`
GeneID	`131026621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026621`
原始查询	`SmilChr05G000202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT3G10720` (AT3G10720) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820241] identity=54.7; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0361500` (OsPME17) - identity=46.3; qcov=1.07; evalue=2.08e-166; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057812518.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057812518.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812518.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1606749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1606843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:1606944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:1606946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:1606969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1607013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr5:1607020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:1607028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:1607044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C27
`Chr5:1607055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C84,D10
`Chr5:1607070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr5:1607092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812518.1

537 aa

268

537

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 29-166 aa PF01095 Pectinesterase 225-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812518.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	29	166	2e-16	61.2	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057812518.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	225	518	2.2e-128	427.9	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956535.1
AATAATACATACAAATATAACCAACCAAACTCCATAGTTACAAAATCAAAATGGCGAATCCGCTTCTCATCTTCTTCCTCTTCACCTTATCTCTAGCTCCGCCCTATTCCGCCGCCGCACCCCCACCGCCCGCCGCCGCCTGCAAATCCACCCCCCACCGCGAGCTATGCCTCTCCATCCTCTCCGCATCCAATTCCGACAACTACGCCAAATTCTCCGTAAAGCAATGCCTCCAACACTCGAGAAAACTATCCGATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026621
ATGGCGAATCCGCTTCTCATCTTCTTCCTCTTCACCTTATCTCTAGCTCCGCCCTATTCCGCCGCCGCACCCCCACCGCCCGCCGCCGCCTGCAAATCCACCCCCCACCGCGAGCTATGCCTCTCCATCCTCTCCGCATCCAATTCCGACAACTACGCCAAATTCTCCGTAAAGCAATGCCTCCAACACTCGAGAAAACTATCCGATTCGATCGCCGATTTTGCCGCCAAGCAGGAGCTGCTCATGAGCTATTCCGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812518.1
MANPLLIFFLFTLSLAPPYSAAAPPPPAAACKSTPHRELCLSILSASNSDNYAKFSVKQCLQHSRKLSDSIADFAAKQELLMSYSETAALDDCRQLQELSAAYLELIAVELKSAAANLSEALACRLQTLLSAVVTNHQTCYDGLVEVGSALAAPLGDAAAVYSVSLGLVTHAFSRKGPRPSGAVAAELDWARYPTSDLFETIHLGKKGRIVEELWEQGIHVNATVTVSPYGGANFTSINDAVASAPNNSAVEDGYFVIYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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