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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000239`

染色体: Chr05 坐标: 1829883-1832630 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000239`
名称	SmilChr05G000239
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1829883 - 1832630 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024756`
GeneID	`131024756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024756`
原始查询	`SmilChr05G000239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=25.3; qcov=0.99; evalue=2.67e-39; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=26.5; qcov=0.639; evalue=4.21e-37; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810277.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810277.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810277.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810277.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1829887`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A9,B118,B136,B20,B25,B38,B56,B9,B94,B96,B99,C15,C22,C24,C75,C87
`Chr5:1830058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:1830062`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B101,B134,B16,B44,B45,C20,C49,C55,C65,C77,D3,D4
`Chr5:1830092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D11
`Chr5:1830135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C41
`Chr5:1830167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B21,B89,B9,C10
`Chr5:1830197`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B127,B133
`Chr5:1830197`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B127,B133
`Chr5:1830198`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B127,B133
`Chr5:1830198`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B127,B133
`Chr5:1830224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B32,C28
`Chr5:1830236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B20,B38,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810277.1

915 aa

458

915

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 213-372 aa PF23598 LRR_14 581-868 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810277.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	213	372	2.4e-25	89.8	NB-ARC domain
`XP_057810277.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	581	868	3.5e-15	56.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954294.1
ATGACAAGTGGCAAGTCAAATACCTTATCCTTCCACCACCTACCAGTCTTGAGTCTACCACCATTCCCAATTTCCCAGCTCCTCCCGCTTCAGACCTTCTTCCACAATCAAGTTATGGCGGCTTATGGTGCAGCGATTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATCTCTCTCGATTCCCACTCTCCACTAATCTTACAACCTGCCTACGACCAGATGGATCGCTTGCTGAAAGTTCTGCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024756
ATGACAAGTGGCAAGTCAAATACCTTATCCTTCCACCACCTACCAGTCTTGAGTCTACCACCATTCCCAATTTCCCAGCTCCTCCCGCTTCAGACCTTCTTCCACAATCAAGTTATGGCGGCTTATGGTGCAGCGATTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATCTCTCTCGATTCCCACTCTCCACTAATCTTACAACCTGCCTACGACCAGATGGATCGCTTGCTGAAAGTTCTGCGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810277.1
MTSGKSNTLSFHHLPVLSLPPFPISQLLPLQTFFHNQVMAAYGAAISLKNTIQRILQSSRISLDSHSPLILQPAYDQMDRLLKVLRLLDETSCSKIRIEVNAADERIKDAVWEFEDLLESHVLPQILPQLESERDNLSFSVDLQSLQHRVDCFVEMVKMMEEEYTNEMENMAEEEGEPISSRIDSGGGMIKSKMVGLSDEFEKARDYLLKGNYYSLDGMAGVGKTTLAKHVFEDPSIQSRFEFRAWVKAGRKCEFDELLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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