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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000332`

染色体: Chr05 坐标: 2473858-2477649 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000332`
名称	SmilChr05G000332
描述	exopolygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2473858 - 2477649 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985052`
GeneID	`130985052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985052`
原始查询	`SmilChr05G000332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exopolygalacturonase-like
产物	exopolygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT1G78400` (AT1G78400) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844176] identity=50.7; qcov=0.932; evalue=3.92e-129; confidence=high
Rice	`Os06g0611400` (OsPGL5) - identity=44.1; qcov=0.98; evalue=3.25e-99; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057763803.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057763803.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763803.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763803.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2474062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B20
`Chr5:2474077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:2474684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B88,C57
`Chr5:2474741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B133,B25,B37,C40
`Chr5:2476384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B5,C41,C58,C6
`Chr5:2476527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:2476671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D2
`Chr5:2476672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:2476731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B127,C39
`Chr5:2476787`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A16,A4,A7,A8,B10,B117,B50,B62,B75,B83,B98,C11,C19,C53,C56,C58,C60,C76,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763803.1

398 aa

199

398

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 62-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763803.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	62	384	1.3e-93	314.4	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907820.1
TTATTATATTTTCTTATTAACTTCTTTAGGATGTTGAAAGTAGTTGTAACATGAAAGACGTCTTTAAACAATTACAAAATTGATTGTTTTGATATGTTGTTGAACTATTAATCTACTACTAATATATAATTATTTAATATTTTATTATTATATTCTTTTTTATTTTGAATTCTTATAAATATTTTTGTTGGATTATGGTGTAATTATTTATTTTTGTATGATTGTTGAAACTCTAGACAGTAATTATGATTTTATTCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985052
ATGGCAAACTTAGCTATTGCTACACTACTTGTGCTGCTATGCTTCATCCTCAACGGCCGCAGCGTATCGCCTTCATCTCTACCACCACGAGTATTCAACGTGATGGCCTACGGCGCCGTCAACGACGGCACCAGAGACAACAGAAAGGCGTTTGTGGCGGCGTGGAGGGATGCGTGCGACTACGAAGGGAGAGGTAGGGTCGTGATTCCCAGAGGCGTCTACGCATTAGGTTCGGTGATATTCGAGGGTTACTGCAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763803.1
MANLAIATLLVLLCFILNGRSVSPSSLPPRVFNVMAYGAVNDGTRDNRKAFVAAWRDACDYEGRGRVVIPRGVYALGSVIFEGYCRGSMSFIIYGVLRAPTDPRFFLTDTWIGFRYVDYLTVKGGGYLDGQGHVAWGYNNCKSNPNCNPLPATMRLDFVRNSWIHHLRSINSKNTHFSIFACQNLTLSNVRLDAPADSPNTDGIHIGSSANIRILNSAIRTGDDCISMVSGCRGVEVADVRCGPGHGISIGSLGRSHADE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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