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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000393`

染色体: Chr05 坐标: 2958246-2961189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000393`
名称	SmilChr05G000393
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2958246 - 2961189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985111`
GeneID	`130985111`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985111`
原始查询	`SmilChr05G000393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12
产物	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12
Arabidopsis	`AT4G21160` (ZAC) Calcium-dependent ARF-type GTPase activating protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827864] identity=71.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0198300` (P0026H03.16-1) - identity=64.7; qcov=0.945; evalue=9.55e-151; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005543 (phospholipid binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985111

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057763871.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057763871.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057763871.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057763871.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057763871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2958527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C42
`Chr5:2958544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr5:2958572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B73
`Chr5:2958593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,B51,C3
`Chr5:2958643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B31,B35
`Chr5:2958653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:2958757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B41,B49,B58
`Chr5:2958758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr5:2958772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr5:2958773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr5:2958791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,C50
`Chr5:2959007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763871.1

330 aa

165

330

ArfGap

PF01412 ArfGap 16-131 aa PF00168 C2 174-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763871.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	16	131	3.2e-39	134.3	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057763871.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	174	261	1.1e-25	90.6	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907888.1
AAAACGAAAAAAAAAAATGAGACCAAAAAAAGGCTGTAATAATAAGTGAAATAAGAAAGTGGACAACTAATGAACTTGGAAGAAACAGTTGTTTTTTCGTTGATTTCAAATCAAATAAAACGGCCCATGGCTTCTCTCTCTCTCTATCATGTTCGCATCAATGAGAATTACTCCTAGTTCTTTCTTCCAAAGAAAGTTCAAAATTTCTTCTGATTACATTTGAAGAAAAGGTTTTTGATAATCATAGTGTTGTTGTATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985111
ATGAACCACCATCCATCTGCTATTGGGAGACAAACTTCAGGTAATAGAGCATTGAAAGACCTCTTGGCTCGACCTGATAATCGTGTATGTGCAGATTGTGGTGCTCCGGATCCAAAATGGGCGTCGTCAAATATAGGAGTTTTTATATGCTTAAAGTGCTCTGGTGTCCATAGAGGCCTCGGCACACATATTTCAAAGGTTCTGTCTGTGACGTTAGATGAATGGTCTGACGATCAAGTGGATTCCATGGTCGAGGTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763871.1
MNHHPSAIGRQTSGNRALKDLLARPDNRVCADCGAPDPKWASSNIGVFICLKCSGVHRGLGTHISKVLSVTLDEWSDDQVDSMVEVGGNASANSIYEAYIPEGVSKPRPDAGPEERSRFIRSKYELQEFLKPSLRILSTTSKPSFRASMSAKISDSFRSSASSQQSEGMVEFIGMLKVKVLKGTNLAVRDMLSSDPYVVLKLGKQRVQTAVVKSNLNPVWNEELMLSVPQEYGPIKLEVYDYDTFSADDIMGEVEIDIQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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