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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000413`

染色体: Chr05 坐标: 3130443-3132833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000413`
名称	SmilChr05G000413
描述	photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3130443 - 3132833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985131`
GeneID	`130985131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985131`
原始查询	`SmilChr05G000413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic
产物	photosystem I reaction center subunit psaK%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G30380` (PSAK) photosystem I subunit K [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839918] identity=80.8; qcov=1.01; evalue=3.05e-72; confidence=high
Rice	`Os07g0148900` (PsaK) - identity=72.6; qcov=0.961; evalue=1.05e-58; confidence=high
GO	GO:0009522 (photosystem I); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01241 (PSI_PSAK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763914.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057763914.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057763914.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763914.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3130521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:3130557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:3130583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:3130608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,D10
`Chr5:3130617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:3130626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A9,B112,B24
`Chr5:3130638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:3130659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C4,C62,C7
`Chr5:3130662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C4,C62,C7
`Chr5:3131081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:3131090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:3131097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763914.1

129 aa

129

PSI_PSAK

PF01241 PSI_PSAK 52-127 aa

XP_057763915.1

129 aa

129

PSI_PSAK

PF01241 PSI_PSAK 52-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763914.1`	Pfam	`PF01241`	PSI_PSAK	Family	52	127	2.4e-18	66.6	Photosystem I psaG / psaK
`XP_057763915.1`	Pfam	`PF01241`	PSI_PSAK	Family	52	127	2.5e-18	66.5	Photosystem I psaG / psaK

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907931.1
TTTGTCACACATCACAATCTTATCTATCTAGAATCAGCCAACCATGGGCTCCCACGTCAGCAACAAGTATCTAAGTGTATCCAAATCAGCTATTCTGAGGCCACAAGCTCTTCATGTGGTTGAAACCAGATTTATTTCTCTCTCCCAAAACTTATAATCACTCTACCAATTTCATAAAATAATATTCACTCACAAAAAAAAGAGAGGGGAAAAAAAAAACTAGCATTTTGAATTGGCAAAAAATGGCATCTGTTGTGATG...

XM_057907932.1
AAACCAGATTTATTTCTCTCTCCCAAAACTTATAATCACTCTACCAATTTCATAAAATAATATTCACTCACAAAAAAAAGAGAGGGGAAAAAAAAAACTAGCATTTTGAATTGGCAAAAAATGGCATCTGTTGTGATGACTTCCCTTCCACAGTTCAATGGGCTGAAGCCCCAAACACCAACTCTCTCTCCTGTCAAGAATTTGGTTACTGTCCCGATGAGGCGTAGGGGACAGGGAGCTTTGGGCGCTCGATGCGACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985131
ATGGCATCTGTTGTGATGACTTCCCTTCCACAGTTCAATGGGCTGAAGCCCCAAACACCAACTCTCTCTCCTGTCAAGAATTTGGTAGCTGTCCCGATGAGGCGTAGGGGACAGGGAGCTTTGGGCGCTCGATGCGACTTCATCGGCTCACCCACAAATTTGATAATGATTACCGCAACGAGTTTGATGTTGTTTGCGGGCCGGTTCGGGTTGGCTCCATCGGCGAACCGAAAGGCGACCGCTGGTCTGAAATTGGAGGC...

LOC130985131
ATGGCATCTGTTGTGATGACTTCCCTTCCACAGTTCAATGGGCTGAAGCCCCAAACACCAACTCTCTCTCCTGTCAAGAATTTGGTTACTGTCCCGATGAGGCGTAGGGGACAGGGAGCTTTGGGCGCTCGATGCGACTTCATCGGCTCACCCACAAATTTGATAATGATTACCGCAACGAGTTTGATGTTGTTTGCGGGCCGGTTCGGGTTGGCTCCATCGGCGAACCGAAAGGCGACCGCTGGTCTGAAATTGGAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763914.1
MASVVMTSLPQFNGLKPQTPTLSPVKNLVAVPMRRRGQGALGARCDFIGSPTNLIMITATSLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEARDSGLQTGDPAGFTLADTLACGTVGHIIGVGVVLGLKNIGAL

XP_057763915.1
MASVVMTSLPQFNGLKPQTPTLSPVKNLVTVPMRRRGQGALGARCDFIGSPTNLIMITATSLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEARDSGLQTGDPAGFTLADTLACGTVGHIIGVGVVLGLKNIGAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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