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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000437`

染色体: Chr05 坐标: 3311009-3316072 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000437`
名称	SmilChr05G000437
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3311009 - 3316072 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985157`
GeneID	`130985157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985157`
原始查询	`SmilChr05G000437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT2
产物	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT2
Arabidopsis	`AT4G21060` (AT4G21060) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827853] identity=63.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0130900` - identity=67.4; qcov=0.811; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0008378 (galactosyltransferase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00337 (Gal-bind_lectin); PF01762 (Galactosyl_T); PF02434 (Fringe)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057763945.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057763945.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763945.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763945.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3311468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D11
`Chr5:3311746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B51,B88,C57
`Chr5:3312002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:3312045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B68,C27,C64,C66
`Chr5:3313776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr5:3314937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:3315140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C22
`Chr5:3315213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B87,C11,C12,C69,D9
`Chr5:3315308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C41
`Chr5:3315330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:3315357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763945.1

681 aa

340

681

Gal-bind_lectin

Galactosyl_T

Fringe

PF00337 Gal-bind_lectin 190-402 aa PF01762 Galactosyl_T 450-630 aa PF02434 Fringe 524-629 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763945.1`	Pfam	`PF00337`	Gal-bind_lectin	Domain	190	402	2.5e-28	98.9	Galactoside-binding lectin
`XP_057763945.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	450	630	1.5e-30	107.2	Galactosyltransferase
`XP_057763945.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	524	629	7.5e-05	22.8	Fringe-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907962.1
ACTCCCTTTTTTTTTGTTTTATAATGTCACATTCTTTTTGGCGCTACATTTTCCTCAATTTCTTAATCTAGGCCCAGCCACCATTTCCCAACCGTAGATTTCCCGCAGCTTCAACCAATGGAGTAAAGAAGAATCATACTACTATAGTATTTTTTTAATTCATTACTTTAATTTTGTCACTGCACGCACAAGATTTAGGGTTTGTCATTGCAAATCACCATCAATTCGATCTGCTGCGTCGTTTTGTTAATTTGTCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985157
ATGAAGAGGTCGAAAGGTGATTATCCGAGCGGAAGAAGGTTCAAGTTCTCGTACGTTCTGTTGGCTGCAGCTGGGTTGTATTTGATCCTTATTTTCTTCAAGTTTCCTGATTTTTTGGAGAGTGCAGCTGTTTTGAGTGGGGAAGAAAGCGCTGGTGTTTTTGATGGATTTTCAATGATGGATGAAAAGAATGCGGAGATTAGTAAATCACGTGTCAGTTTTGATGGGTTCCACAGAATATTACATGATAATGAAAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763945.1
MKRSKGDYPSGRRFKFSYVLLAAAGLYLILIFFKFPDFLESAAVLSGEESAGVFDGFSMMDEKNAEISKSRVSFDGFHRILHDNENQDNPVKPQQGDIQAERDWKSVTKSSQQQYGRITSDILRKMNRTKNLSVMERMADEAWALGLKAWEEASKYDDKEIDMSTILEGKPESCPSWVSMDGEELVKRDYLMFLPCGLAAGSSITVIGTPHHAHQEYVPQLAKRRVDDGLVLVSQFMVELQGLKAVHGEDPPKILHLNPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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