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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000438`

染色体: Chr05 坐标: 3317114-3319588 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000438`
名称	SmilChr05G000438
描述	phosphoribosylamine--glycine ligase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3317114 - 3319588 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985158`
GeneID	`130985158`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985158`
原始查询	`SmilChr05G000438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoribosylamine--glycine ligase-like
产物	phosphoribosylamine--glycine ligase-like
Arabidopsis	`AT1G09830` (PUR2) Glycinamide ribonucleotide (GAR) synthetase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837515] identity=75.2; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0191200` (VAL1) - identity=81.7; qcov=0.845; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004637 (phosphoribosylamine-glycine ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0009113 (purine nucleobase biosynthetic process); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01071 (GARS_A); PF02843 (GARS_C); PF02844 (GARS_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985158

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763947.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057763947.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763947.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763947.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3317371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B51,B88,C57
`Chr5:3317473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B127,B129,C15,C74
`Chr5:3317499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:3317511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B64
`Chr5:3317650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:3317675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:3317695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B12,B7,C15,C74
`Chr5:3317960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C33
`Chr5:3317983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C13
`Chr5:3318187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B108
`Chr5:3318224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B82,D10
`Chr5:3318415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763947.1

517 aa

258

517

GARS_N

GARS_A

GARS_C

PF02844 GARS_N 82-183 aa PF01071 GARS_A 184-378 aa PF02843 GARS_C 413-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763947.1`	Pfam	`PF02844`	GARS_N	Domain	82	183	1.7e-32	112.8	Phosphoribosylglycinamide synthetase, N domain
`XP_057763947.1`	Pfam	`PF01071`	GARS_A	Domain	184	378	2.1e-83	279.6	Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain
`XP_057763947.1`	Pfam	`PF02843`	GARS_C	Domain	413	506	1.4e-32	112.6	Phosphoribosylglycinamide synthetase, C domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907964.1
ATGGCACTCGCTTGCTCAAATGGTGTTCAATTTTTGGACAGCCATAGTCATATTCTCAGTTCGACGCCGAAATCTTTTACCTCAATCTGTTTTCGCGTGAGACCCATCAAATGGGTCGCTCAGAAAAGTGGTTCTAGTAGCTCCGCTCGTCTCTGCCGGAGGAATAATAATCAATCTGCTATGCTTGTATTTAACGCCATTGCTTCAAACAACGTGCCCTCCTCTGCTGCTGAGGAAAATATAGCTGTGCTGGTTATTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985158
ATGGCACTCGCTTGCTCAAATGGTGTTCAATTTTTGGACAGCCATAGTCATATTCTCAGTTCGACGCCGAAATCTTTTACCTCAATCTGTTTTCGCGTGAGACCCATCAAATGGGTCGCTCAGAAAAGTGGTTCTAGTAGCTCCGCTCGTCTCTGCCGGAGGAATAATAATCAATCTGCTATGCTTGTATTTAACGCCATTGCTTCAAACAACGTGCCCTCCTCTGCTGCTGAGGAAAATATAGCTGTGCTGGTTATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763947.1
MALACSNGVQFLDSHSHILSSTPKSFTSICFRVRPIKWVAQKSGSSSSARLCRRNNNQSAMLVFNAIASNNVPSSAAEENIAVLVIGGGGREHALCYALQRSPSCVSVFCAPGNAGISGSGDATCIEDLDISDSSAVIAFCCERSIGLVVVGPEAPLVAGLANDLVKAGIPTFGPSSEAAALEGSKDFMKRLCDKYDIPTAKYRTFTDPSAAKAYIEAQGVPIVVKADGLAAGKGVVVAMTMDEAFEAIDSMLVKNVFGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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