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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000464`

染色体: Chr05 坐标: 3509127-3511881 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000464`
名称	SmilChr05G000464
描述	protease Do-like 5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3509127 - 3511881 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985185`
GeneID	`130985185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985185`
原始查询	`SmilChr05G000464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protease Do-like 5, chloroplastic
产物	protease Do-like 5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G18370` (DEG5) DEGP protease 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827564] identity=69.9; qcov=0.752; evalue=8.02e-119; confidence=high
Rice	`Os04g0459900` (OsDegp5) - identity=49.6; qcov=0.748; evalue=6.41e-60; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00089 (Trypsin); PF13365 (Trypsin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763994.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057763994.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057763995.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057763994.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3509277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C61
`Chr5:3509666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A4,B103,B53,B93
`Chr5:3510198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D11
`Chr5:3510205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:3510219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr5:3510220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C1
`Chr5:3510441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B33,B53
`Chr5:3511618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr5:3511680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B71,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763994.1

329 aa

164

329

Trypsin_2

Trypsin

PF13365 Trypsin_2 126-286 aa PF00089 Trypsin 127-311 aa

XP_057763995.1

318 aa

159

318

Trypsin_2

Trypsin

PF13365 Trypsin_2 126-275 aa PF00089 Trypsin 127-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763994.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	126	286	8.6e-32	111.6	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057763994.1`	Pfam	`PF00089`	Trypsin	Domain	127	311	1.9e-16	61.3	Trypsin
`XP_057763995.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	126	275	4.7e-33	115.7	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057763995.1`	Pfam	`PF00089`	Trypsin	Domain	127	300	8.5e-18	65.7	Trypsin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908011.1
AAATATGTTACTTTCTCTTCATATCATAGAAATATTTCTTATCCCCTCCAACGTGTATTTTCTTCCTATTTAAAGGAAGAAACTCAATATTGAGAGCTGCAATGGCGAAATTGGGTTTCGCAATGTGCGTGAAATCTTCAATTCCACCGCATCGCACTCCCTCCTCTTGCTTAAATTCAGACAGCTGCGCCGCCATAACAAGGCGAAAAACCTTAATCTTCACTACTTCTTTCCTCGCAACATATTTGCATTGGCATCAA...

XM_057908012.1
AATATGTTACTTTCTCTTCATATCATAGAAATATTTCTTATCCCCTCCAACGTGTATTTTCTTCCTATTTAAAGGAAGAAACTCAATATTGAGAGCTGCAATGGCGAAATTGGGTTTCGCAATGTGCGTGAAATCTTCAATTCCACCGCATCGCACTCCCTCCTCTTGCTTAAATTCAGACAGCTGCGCCGCCATAACAAGGCGAAAAACCTTAATCTTCACTACTTCTTTCCTCGCAACATATTTGCATTGGCATCAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985185
ATGGCGAAATTGGGTTTCGCAATGTGCGTGAAATCTTCAATTCCACCGCATCGCACTCCCTCCTCTTGCTTAAATTCAGACAGCTGCGCCGCCATAACAAGGCGAAAAACCTTAATCTTCACTACTTCTTTCCTCGCAACATATTTGCATTGGCATCAAAATCCAAATCCAAATCTCTCCACTTCTCCACCAGCCATTGCTCAGGAATTCGATGATGATCTTGATAAAGAAGAAACTCGAGTCGTTCAAATTTTTCAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763994.1
MAKLGFAMCVKSSIPPHRTPSSCLNSDSCAAITRRKTLIFTTSFLATYLHWHQNPNPNLSTSPPAIAQEFDDDLDKEETRVVQIFQETSSSVVYIKDLELAEIPKSSSGNNIGEAEDDNAKVEGTGSGFIWDKFGHIVTNYHVVSKLAKDTSGLQRYACEERCLRLPLQVYLVDSGGKSITRDGKIVGFDPDYDLAVLKVDAVGNELKPVRISTSGELQVGQSCFAIGNPYGYENTLTTGVISGLGREIPSPNGRAIRGA...

XP_057763995.1
MAKLGFAMCVKSSIPPHRTPSSCLNSDSCAAITRRKTLIFTTSFLATYLHWHQNPNPNLSTSPPAIAQEFDDDLDKEETRVVQIFQETSSSVVYIKDLELAEIPKSSSGNNIGEAEDDNAKVEGTGSGFIWDKFGHIVTNYHVVSKLAKDTSGLQRCKVYLVDSGGKSITRDGKIVGFDPDYDLAVLKVDAVGNELKPVRISTSGELQVGQSCFAIGNPYGYENTLTTGVISGLGREIPSPNGRAIRGAIQTDAAINAGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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