当前解析结果
SmilChr05G000496| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000496 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000496 |
| 描述 | inositol-3-phosphate synthase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 3870060 - 3871638 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985221 |
|---|---|
| GeneID | 130985221 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985221 |
| 原始查询 | SmilChr05G000496 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | inositol-3-phosphate synthase-like |
| 产物 | inositol-3-phosphate synthase-like |
| Arabidopsis | AT5G10170 (MIPS3)myo-inositol-1-phosphate synthase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830881] identity=89.61; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high |
| Rice | Os03g0192700 (OsINO1)- identity=86.08; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high |
| GO | GO:0004512 (inositol-3-phosphate synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006021 (inositol biosynthetic process); GO:0008654 (phospholipid biosynthetic process) |
| KEGG | smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01658 (Inos-1-P_synth); PF07994 (NAD_binding_5) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985221 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057764040.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057764040.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:3870372 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr5:3870384 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr5:3870594 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:3871352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr5:3871517 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B115 |
Chr5:3871517 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr5:3871564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764040.1PF07994
NAD_binding_5 62-494 aa
PF01658
Inos-1-P_synth 310-423 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764040.1 |
Pfam | PF07994 |
NAD_binding_5 | Family | 62 | 494 | 5.1e-142 | 473.8 | Myo-inositol-1-phosphate synthase |
XP_057764040.1 |
Pfam | PF01658 |
Inos-1-P_synth | Family | 310 | 423 | 3.6e-37 | 127.5 | Myo-inositol-1-phosphate synthase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。