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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000619`

染色体: Chr05 坐标: 4676178-4677805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000619`
名称	SmilChr05G000619
描述	probable WRKY transcription factor 65
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4676178 - 4677805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985307`
GeneID	`130985307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985307`
原始查询	`SmilChr05G000619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 65
产物	probable WRKY transcription factor 65
Arabidopsis	`AT1G29280` (WRKY65) WRKY DNA-binding protein 65 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839802] identity=47; qcov=0.88; evalue=2.27e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0750100` (WRKY13) - identity=38.7; qcov=1.04; evalue=6.34e-51; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764205.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764205.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764205.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764205.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4676693`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A2,A7,B101,B115,B123,B20,B34,B42,B43,B44,B59,B63,B66,B69,B84,B88,B95,B98,C14,C2,C30,C32,C37,C44,C47,C6,C7,C76
`Chr5:4676821`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	137	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B117,B119,B12,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B21,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B35,B37,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B53,B56,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B72,B74,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B90,B92,B95,B96,C1,C10,C11,C13,C15,C16,C20,C21,C27,C28,C29,C3,C33,C34,C36,C37,C4,C40,C43,C46,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C67,C69,C71,C8,C81,C82,C83,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr5:4676823`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	135	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B117,B119,B12,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B21,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B35,B37,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B53,B56,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B72,B74,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B90,B92,B95,B96,C1,C10,C11,C13,C15,C16,C20,C21,C27,C28,C29,C3,C33,C34,C36,C37,C4,C40,C43,C46,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C67,C69,C71,C8,C81,C82,C83,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr5:4676863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr5:4676905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr5:4677266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C25,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764205.1

300 aa

150

300

WRKY

PF03106 WRKY 82-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764205.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	82	139	1.3e-25	90.1	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908222.1
ATTCGGACCCATATTAAAACCCACCACCCAATCCCACCACCTCTCTTCCTCCATTTCTTGTTCTCATCAATCTCTTTCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTACCACACTCCCTGCAACTACTCCACCGCCATGGACGCCGGCTTCAACCGCCACCGCCACCGCTTCGTTAACGAGCTCGACGACTCCGACAATTCCGCCGGAAACAGCGGGGGAGATTCCCCGCGCTCCGCCGTCTCTACTGACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985307
ATGGACGCCGGCTTCAACCGCCACCGCCACCGCTTCGTTAACGAGCTCGACGACTCCGACAATTCCGCCGGAAACAGCGGGGGAGATTCCCCGCGCTCCGCCGTCTCTACTGACACCAAGATCGCTTCCACATCCTCTTCCAAAAGAAGTAGGAGAGCCATACAGAAAAGAGTGGTGTCAGTGCCAATCAAGGACGTGGAAGGATTAAGGCAGAAGGGTGATCAGATTAGCGCTCCGCCGTCCGATTCTTGGGCCTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764205.1
MDAGFNRHRHRFVNELDDSDNSAGNSGGDSPRSAVSTDTKIASTSSSKRSRRAIQKRVVSVPIKDVEGLRQKGDQISAPPSDSWAWRKYGQKPIKGSPYPRGYYRCSSSKGCPARKQVERSRLDPKMLVVTYYCEHNHNWPVSKSSHHKTAAARNVKTPISEEEEEEEEEEEEEGEEVEEEKKPRINLSDQSRDEVAIGAADNKFSTNNHGGEGLSIQNGEFGWFADFECANFTMLESPMLAEERISTDSEMAMIFTMGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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