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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000626`

染色体: Chr05 坐标: 4728857-4730058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000626`
名称	SmilChr05G000626
描述	uncharacterized SmilChr05G000626
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4728857 - 4730058 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985338`
GeneID	`130985338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985338`
原始查询	`SmilChr05G000626`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764255.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764256.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764256.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764255.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4729038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B107,B108,B111,B21,B51,B58,B65,B71,B77,B9,B92,C28,C57,C58,C72,C83
`Chr5:4729052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B107,B108,B111,B21,B51,B58,B65,B71,B77,B9,B92,C28,C57,C58,C72,C83
`Chr5:4729058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B65,B77
`Chr5:4729270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:4729331`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A15,A16,A22,A24,B1,B100,B107,B114,B118,B130,B132,B18,B19,B2,B22,B23,B27,B28,B3,B31,B32,B33,B36,B39,B44,B49,B6,B65,B67,B70,B77,B97,C18,C24,C29,C31,C38,C40,C41,C66,C80,C86
`Chr5:4729336`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A15,A16,A22,A24,B1,B100,B107,B114,B118,B130,B132,B18,B19,B2,B22,B23,B27,B28,B3,B32,B33,B36,B39,B44,B49,B6,B65,B67,B70,B77,B97,C24,C29,C31,C40,C41,C66,C80,C86
`Chr5:4729345`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A16,A22,A24,B1,B107,B114,B118,B130,B132,B18,B2,B22,B23,B28,B33,B36,B39,B44,B49,B65,B67,B77,B97,C24,C29,C31,C40,C41,C66,C80,C86
`Chr5:4729346`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A16,A22,A24,B1,B107,B114,B118,B130,B132,B18,B2,B22,B23,B28,B33,B36,B39,B44,B49,B65,B67,B77,B97,C24,C29,C31,C40,C41,C66,C80,C86
`Chr5:4729408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B16,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764255.1

162 aa

162

RINGv

PF12906 RINGv 44-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764255.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	44	95	1.5e-10	41.7	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908272.1
CATAGAAAAATAAAAGTCCAAAATCACATGCTTCACATTTCGACGTTGCTTCACCCTCTCTCTCTCTCAAAATACGATTGCATTGTATGGCAGCCAATTCCGGGTTCGGCACCAATCATTATACAGAAATACAGTTGTCTAAACAGTCTTTTATTTGCACATATATGGTGTGTTTATTGGTGTATTCTGTGCACACACGATAAGTAAACAATTCGAAATTAGACTTCACAAAGGGGATAACTTATAACAACCCAATAATT...

XM_057908273.1
CGATTGCATTGTATGGCAGCCAATTCCGGGTTCGGCACCAATCATTATACAGAAATACAGTTGTCTAAACAGTCTTTTATTTGCACATATATGGTGTGTTTATTGGTGTATTCTGTGCACACACGATAAGTAAACAATTCGAAATTAGACTTCACAAAGGGGATAACTTATAACAACCCAATAATTCATGTCAGCTTCACAAAGTGTATTTATCATGCGTGCTTTATAGCATTTAATAATCTCTGACAGAATAAGTTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985338
ATGGATCAAGAACAAGACTGTGGTAGTTCAAGAAATTTGGAAACTGTGATTGCAGTAGGCGGCAGTGACTTGGAAGGTGGAAACGAGGCGTGTTCGTCTTGCTCGATGATCGAGCTCAATGAGAAGGTCTGTAGAGTATGCCATTTGAGTGCAAAGGACATTGGCAAGAGCGCAGTTGAGTTGATCGAGCTTGGCTGCGGATGTAAAGGTGAGCTTGGATTTGCTCACTTGCAATGCGCCGAGGCTTGGTTTAGAGTTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764255.1
MDQEQDCGSSRNLETVIAVGGSDLEGGNEACSSCSMIELNEKVCRVCHLSAKDIGKSAVELIELGCGCKGELGFAHLQCAEAWFRVKGNRLCEICGEAARNISGVGHSNFMAEWNERRWSDGSNGTSDESRRCLQGQPLCNFLMACLVIAFILPWFFRVNLF

XP_057764256.1
MDQEQDCGSSRNLETVIAVGGSDLEGGNEACSSCSMIELNEKVCRVCHLSAKDIGKSAVELIELGCGCKDCVKYVARLQEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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