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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000663`

染色体: Chr05 坐标: 5011015-5012088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000663`
名称	SmilChr05G000663
描述	homeobox-leucine zipper protein HOX17-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5011015 - 5012088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985376`
GeneID	`130985376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985376`
原始查询	`SmilChr05G000663`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HOX17-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HOX17-like
Arabidopsis	`AT2G44910` (HB4) homeobox-leucine zipper protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819100] identity=84; qcov=0.405; evalue=2.13e-51; confidence=low
Rice	`Os04g0548700` (Oshox17) - identity=83.7; qcov=0.397; evalue=3.72e-48; confidence=low
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764317.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057764317.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764317.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764317.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5011058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:5011088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B114,B88,C62,D10
`Chr5:5011089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B7,B94,C18,C23,C31
`Chr5:5011090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:5011123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B21,B46,B60,B68,B91,B96
`Chr5:5011129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A2,A4,B114,B117,B121,B122,B130,B131,B137,B2,B42,B47,B54,B56,B60,B88,B9,B97,C54,C59,C62,C65,C83,D10,D4,D9
`Chr5:5011144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr5:5011148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B100,B23,D2
`Chr5:5011148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B23,D2
`Chr5:5011160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B13,B2
`Chr5:5011817`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B111,C80
`Chr5:5011817`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B111,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764317.1

232 aa

116

232

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 50-80 aa PF02183 HALZ 82-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764317.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	50	80	6.2e-10	39.5	Homeodomain
`XP_057764317.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	82	116	2.8e-11	44.1	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908334.1
CAATGGGCCGGATCTGGACCGGATCCTGCTTGGTCCAGATCCAGATCCGTGTTTTTATGCTTAGATCCAGATCCGGTCCAGATCCATTGGATCCAAAAAAATGAGATCCAGACCCAGATCCATGAGATCCACTGGATCTCGGGTCCAGACCCAGATCCATACTGCGCGTTGGCGAAGCAGCTGAATCTGCGGCCAAGGCAAGTGGAGGTGTGGTTCCAGAACAGAAGGGCAAGGACCAAGTTGAAGCAAACGGAGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985376
CAATGGGCCGGATCTGGACCGGATCCTGCTTGGTCCAGATCCAGATCCGTGTTTTTATGCTTAGATCCAGATCCGGTCCAGATCCATTGGATCCAAAAAAATGAGATCCAGACCCAGATCCATGAGATCCACTGGATCTCGGGTCCAGACCCAGATCCATACTGCGCGTTGGCGAAGCAGCTGAATCTGCGGCCAAGGCAAGTGGAGGTGTGGTTCCAGAACAGAAGGGCAAGGACCAAGTTGAAGCAAACGGAGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764317.1
QWAGSGPDPAWSRSRSVFLCLDPDPVQIHWIQKNEIQTQIHEIHWISGPDPDPYCALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLRRCCENLTEENRRLQKEVNELRALKLSPQLYMNMSPPTTLTMCPQCERVAVSSSSTLRLRVLCSAHVETGDFTLLCSAADRRWGRPALQQTGGGRRPEVGKAGGADTGGWVSRAIGAWRIGERRKWDGRSRVSNLKWNFKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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