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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000757`

染色体: Chr05 坐标: 5865174-5869422 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000757`
名称	SmilChr05G000757
描述	caffeoylshikimate esterase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5865174 - 5869422 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985471`
GeneID	`130985471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985471`
原始查询	`SmilChr05G000757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoylshikimate esterase-like
产物	caffeoylshikimate esterase-like
Arabidopsis	`AT2G39420` (AT2G39420) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818527] identity=57.8; qcov=1; evalue=2.97e-129; confidence=high
Rice	`Os12g0262700` - identity=56; qcov=0.98; evalue=1.96e-119; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057764440.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057764440.1`
3	Lipid droplet	脂滴	1.00000	`XP_057764440.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057764440.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5865474`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr5:5865474`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr5:5865500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:5865535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,D2
`Chr5:5865755`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A15,B1,B31,B56,B6,B7,B96,C11,C63,C69
`Chr5:5865933`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A4,B23,C74,D4
`Chr5:5868760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C26
`Chr5:5868916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:5868920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B125,B34,B61,C5,C63,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764440.1

295 aa

148

295

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 34-271 aa PF00561 Abhydrolase_1 38-269 aa PF12697 Abhydrolase_6 39-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764440.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	34	271	1.8e-58	198.4	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057764440.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	38	269	2.7e-16	60.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057764440.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	39	270	1.6e-11	45.9	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908457.1
CTTCATTACATTAGTGTTAATTTAATCTATCATAATATAATATTTTATATTACTGAGACAATTTTGTCATGGAATCAGGAAGCACTGAATTCAGATATGAAGAGGAATTCATTTATAATTCGAGAGGAATGAAGCTCTTCACATGTAGTTGGGTGCCTGCACATTCTGAGCCTAAAGGATTAGTCTTCTTGTGCCATGGATATGGCTTAGAGTGCAGTGTCTCCTTGAGAGGGTGCGGTATTAGACTTGCAAAGGCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985471
ATGGAATCAGGAAGCACTGAATTCAGATATGAAGAGGAATTCATTTATAATTCGAGAGGAATGAAGCTCTTCACATGTAGTTGGGTGCCTGCACATTCTGAGCCTAAAGGATTAGTCTTCTTGTGCCATGGATATGGCTTAGAGTGCAGTGTCTCCTTGAGAGGGTGCGGTATTAGACTTGCAAAGGCTGGCTATGCAGTTTATGGCATTGACTACCAAGGCCATGGCAAGTCGTCTGGGCTTCAATGTTACATCCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764440.1
MESGSTEFRYEEEFIYNSRGMKLFTCSWVPAHSEPKGLVFLCHGYGLECSVSLRGCGIRLAKAGYAVYGIDYQGHGKSSGLQCYIPNFDHLVNDCFHHFTSIYERQENKKIKKILMGESMGGAVALLLHIKAPSYWDMAVLVAPMCKFAEELKPHPVWISIGDMLSYVIPTWITPFGEVIDAAFRVPEIRDEVRRNPLCYKGGVRLGTATQLWKTSLELEARLEQVSLPFLLMHGAQDRVIHPSHTQLLHQRAPSTDKTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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