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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000864`

染色体: Chr05 坐标: 6851903-6856617 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000864`
名称	SmilChr05G000864
描述	protein PELOTA 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6851903 - 6856617 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985576`
GeneID	`130985576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985576`
原始查询	`SmilChr05G000864`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PELOTA 1
产物	protein PELOTA 1
Arabidopsis	`AT4G27650` (PEL1) Eukaryotic release factor 1 (eRF1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828876] identity=79.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0659900` (LML1) - identity=74.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0032790 (ribosome disassembly); GO:0070481 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay); GO:0070651 (nonfunctional rRNA decay); GO:0070966 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay); GO:0071025 (RNA surveillance)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03464 (eRF1_2); PF03465 (eRF1_3); PF26356 (Pelota_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764603.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764603.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6852850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B79,C54
`Chr5:6853869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:6854059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B82
`Chr5:6854360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C19,D10
`Chr5:6854375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B79,C54
`Chr5:6854411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B134,B47,C5,D7
`Chr5:6854654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B113,B64
`Chr5:6854681`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A19,A5,A6,B100,B107,B111,B113,B114,B15,B2,B3,B31,B42,B49,B56,B59,B63,B64,B65,B66,B71,B75,B90,C2,C47,C5,C50,C55,C7,C78,C82,C86,D2
`Chr5:6854690`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A11,B46,B50,C1,C48,C69
`Chr5:6854694`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A19,A5,A6,B100,B107,B111,B113,B114,B15,B2,B3,B31,B49,B56,B59,B63,B64,B65,B66,B71,B75,B90,C2,C47,C5,C50,C55,C7,C78,C82,C86,D2
`Chr5:6854715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764603.1

378 aa

189

378

Pelota_N

eRF1_2

eRF1_3

PF26356 Pelota_N 1-128 aa PF03464 eRF1_2 137-268 aa PF03465 eRF1_3 272-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764603.1`	Pfam	`PF26356`	Pelota_N	Domain	1	128	2e-45	154.5	Pelota N-terminal domain
`XP_057764603.1`	Pfam	`PF03464`	eRF1_2	Domain	137	268	2.3e-28	99.9	eRF1 domain 2
`XP_057764603.1`	Pfam	`PF03465`	eRF1_3	Domain	272	370	2.5e-29	102.6	eRF1 domain 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908620.1
ATAATATTATGACATAATATATGGAGTATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTCTTGTTAAAATAAAACAAGTATGGTGCACAAATCGAACTCCACCGACGCCGACCACCGTTGATTAGACACGGAATGTTGTTAATCAGGAACCCTAGAGCAATTTTAATTTGCTACTTCTGTACAAACTGTTTCAATTTACAAGTATAGCGTAAACTTCATTCAGCATCAGCTTGGGGAAGACTAAGCACGCAAAAGAGAGAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985576
ATGAAGATCGTTCGGAGAGACCTGACGCGCAACGGGCCTGGAAGTGTGAAGATGATTCCAGAAGAAGCAGATGATCTATGGGTTGCTTATAATTTGATTGTAGAGGGCGATAATGTAATGGCCGTCACAGTCAGAAAGGTTATGAGAGAAGCTGCTTCAGGAGGAAGGGATGCCGAAAGAGTGAAACTGAAACTAGAAATCAAAGTTGAGACTGTCGAGTATGATAAAGAAGGAGCTGTCTTACGCATACGTGGGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764603.1
MKIVRRDLTRNGPGSVKMIPEEADDLWVAYNLIVEGDNVMAVTVRKVMREAASGGRDAERVKLKLEIKVETVEYDKEGAVLRIRGKNVLENEHVKIGAFHTLEIELNRPFVLRKDIWDSLALDVIHQASDPKASADLAVVLMQEGLCHILLVGKSMTITRARIETSIPRKHGPAVAGYDKALSKFFENILQAFLKHVDFNVVRCAVIASPGFTKDQFHKHLLLEAERRQLRSVIENKSRIILVHTTSGYKHSLREVLDAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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