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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000865`

染色体: Chr05 坐标: 6861876-6864054 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000865`
名称	SmilChr05G000865
描述	uncharacterized SmilChr05G000865
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6861876 - 6864054 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985578`
GeneID	`130985578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985578`
原始查询	`SmilChr05G000865`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828243]; symbol=AT4G21580; hit=AT4G21580; species=arabidopsis; confidence=high
产物	oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828243]; symbol=AT4G21580; hit=AT4G21580; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21580` (AT4G21580) oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828243] identity=74; qcov=0.991; evalue=5.36e-178; confidence=high
Rice	`Os02g0805600` - identity=70.3; qcov=1; evalue=4.1e-169; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF08240 (ADH_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764607.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057764607.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764607.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057764607.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764607.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6862163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:6862188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A3,B74,C46
`Chr5:6862205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:6862233`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr5:6862233`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr5:6863128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B56,B96,D1
`Chr5:6863362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B87,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764607.1

326 aa

163

326

ADH_N

ADH_zinc_N

ADH_zinc_N_2

PF08240 ADH_N 27-109 aa PF00107 ADH_zinc_N 151-267 aa PF13602 ADH_zinc_N_2 183-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764607.1`	Pfam	`PF08240`	ADH_N	Domain	27	109	6.8e-17	62.3	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
`XP_057764607.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	151	267	2.3e-32	112.3	Zinc-binding dehydrogenase
`XP_057764607.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	183	323	3.3e-25	90.3	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908624.1
ATATTTGAATTTCGTTTCAAAATAATGAGGGGACACGGAAGTTGATTAATGAATAATTGCGTGGACAAAAATCCAAGGTAGCGTCCCAGTGTATTTCGACGACGGCTAAGACGAAGACGGTCATCCCAAATTCAGAGCAAAACCCTCGGCGACGATAAAATCATGAAGGCGATTGTGATCACCGAAGCAGGCGGCCCCGAAGTCCTGCAATTGCAAGAAGTGGAGGCCCCAAAAATGAAAGACGACGAAGTTTTGATCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985578
ATGAAGGCGATTGTGATCACCGAAGCAGGCGGCCCCGAAGTCCTGCAATTGCAAGAAGTGGAGGCCCCAAAAATGAAAGACGACGAAGTTTTGATCAGAGTTGCCGCCACTGCTCTCAACAGAGCCGACACACTTCAGCGCCAGGGCAGGCACCCTGCCCCTAAGGGCGATAGCGAGTTTCCCGGTCTTGAATGCTCCGGTGTCGTTGAAGCCGTCGGCAGAAATGTCCGCCGCTGGAAGATCGGCGATCAGGTGTGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764607.1
MKAIVITEAGGPEVLQLQEVEAPKMKDDEVLIRVAATALNRADTLQRQGRHPAPKGDSEFPGLECSGVVEAVGRNVRRWKIGDQVCALVGGGGYAEKVAVPGGQVLPVPPNISLQDAASFPEVACTVWSTIVMMSHLSQGENFLIHGGSSGIGTFAIQLAKYLGVKVFITAGSEEKLAACKELGADVCINYKTEDFVSRVKEETGGKGVDVILDNIGASYLKRNLESLNFNGRLFIIGLMGGSVTEINLASLLARRLTVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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