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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000929`

染色体: Chr05 坐标: 7448492-7450287 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000929`
名称	SmilChr05G000929
描述	NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7448492 - 7450287 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985644`
GeneID	`130985644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985644`
原始查询	`SmilChr05G000929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like
产物	NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like
Arabidopsis	`AT4G27270` (AT4G27270) Quinone reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828835] identity=84.7; qcov=0.744; evalue=2.05e-126; confidence=high
Rice	`Os08g0139200` - identity=81.8; qcov=0.744; evalue=3.68e-120; confidence=high
GO	GO:0003955 (NAD(P)H dehydrogenase (quinone) activity); GO:0010181 (FMN binding)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00258 (Flavodoxin_1); PF02525 (Flavodoxin_2); PF03358 (FMN_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764697.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764697.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764697.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764697.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7448525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C34,C40,C8,C82
`Chr5:7449394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B16,B69,B7,C30
`Chr5:7449529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:7449548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C83,C84
`Chr5:7450020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764697.1

273 aa

136

273

Flavodoxin_2

Flavodoxin_1

FMN_red

PF02525 Flavodoxin_2 75-194 aa PF00258 Flavodoxin_1 77-203 aa PF03358 FMN_red 85-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764697.1`	Pfam	`PF02525`	Flavodoxin_2	Domain	75	194	1.8e-06	28.5	Flavodoxin-like fold
`XP_057764697.1`	Pfam	`PF00258`	Flavodoxin_1	Domain	77	203	2.1e-07	31.9	Flavodoxin
`XP_057764697.1`	Pfam	`PF03358`	FMN_red	Domain	85	215	2.1e-13	50.8	NADPH-dependent FMN reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908714.1
ACATGTTAATTCAGAAATTCAAATTTGAGGAAAGACGAAGAATTAAATTTAGGCTTCGAGATCCAGAGTGTAGTCCTCTAGGCAAAGCCGAACAACACGACAAGCTTAGTTTGGTCAACGGCTGCTCATCCATTACACTTACATTTACAAATTATATATACCGCCCTTTCTTCTCATTATTCATATTCACCAAAAACACACCCTTCATTGCAATGGCGGTCAAGGTCTACATAGTTTACTATTCCACATACGGGCATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985644
ATGTTAATTCAGAAATTCAAATTTGAGGAAAGACGAAGAATTAAATTTAGGCTTCGAGATCCAGAGTGTAGTCCTCTAGGCAAAGCCGAACAACACGACAAGCTTAGTTTGGTCAACGGCTGCTCATCCATTACACTTACATTTACAAATTATATATACCGCCCTTTCTTCTCATTATTCATATTCACCAAAAACACACCCTTCATTGCAATGGCGGTCAAGGTCTACATAGTTTACTATTCCACATACGGGCATGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764697.1
MLIQKFKFEERRRIKFRLRDPECSPLGKAEQHDKLSLVNGCSSITLTFTNYIYRPFFSLFIFTKNTPFIAMAVKVYIVYYSTYGHVERLAEEIKKGAESVEGVEAKLWQVPETLSGEILAKMSAPPKSDVAVITPDQLPEADGLIFGFPTRFGMMAAQFKAFFDATGGLWRTQALAGKPAGIFYCTGSQGSGQETTALTAITQLTHHGMIFVPIGYTFGAGMFEMEQVKGGSPYGAGTFAGDGSRQPSELELGQAFHQGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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