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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000955`

染色体: Chr05 坐标: 7697891-7702088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000955`
名称	SmilChr05G000955
描述	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7697891 - 7702088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985669`
GeneID	`130985669`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985669`
原始查询	`SmilChr05G000955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4, mitochondrial-like
产物	cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-4%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G13430` (AT5G13430) Ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831184] identity=75; qcov=1; evalue=2.8e-150; confidence=high
Rice	`Os02g0520800` - identity=72.8; qcov=1; evalue=2.41e-142; confidence=high
GO	GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c); GO:0008121 (quinol-cytochrome-c reductase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00355 (Rieske); PF02921 (UCR_TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985669

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057764729.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057764729.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057764729.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057764729.1`
5	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057764729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7698093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C83
`Chr5:7698164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B94
`Chr5:7701313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:7701399`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr5:7701399`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr5:7701470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C36
`Chr5:7701602`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr5:7701602`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr5:7701751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B103,B64,B67,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764729.1

275 aa

138

275

UCR_TM

Rieske

PF02921 UCR_TM 107-146 aa PF00355 Rieske 204-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764729.1`	Pfam	`PF02921`	UCR_TM	Family	107	146	8.9e-10	39.5	Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region
`XP_057764729.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	204	260	4e-09	37.0	Rieske [2Fe-2S] domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908746.1
AACGACCGACTCTTACATTTGCCCCTCTCTTCTTTTCCTCTTCTCTTAATTAGGCTACTCTTCTGCCAGAGCAACCCTAGGTGCAAGCTCCCATCCCAAATCCATTACAATTTCCGAATCGGTATCCCTGCAAAGAAGTTGGAGATGCTGAGAGTAGCAGGGAGGAGGCTGTCTTCTCTCTCATGGCTGTCTGCTCAGCCTTCGTCCGCCGCGCTAGCGTCCAGGAATCCGTTCACGCTCGCTGATTCATCCTCCAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985669
ATGCTGAGAGTAGCAGGGAGGAGGCTGTCTTCTCTCTCATGGCTGTCTGCTCAGCCTTCGTCCGCCGCGCTAGCGTCCAGGAATCCGTTCACGCTCGCTGATTCATCCTCCAGCGGCCGCACCGCATCTGTTTCTTCACCTGCGGATTCGTTTGCCTGCATCAACTCCTTTCCCAGTCTCATCCGAGGCTTTTCTTCTAATGCCATTGCTCCAGGACATGATATTGGTCTGATTTCGGAGTTGCCTACGGTGGCAGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764729.1
MLRVAGRRLSSLSWLSAQPSSAALASRNPFTLADSSSSGRTASVSSPADSFACINSFPSLIRGFSSNAIAPGHDIGLISELPTVAAIKNPSSKIVYDEHNHERYPPGDPSKRAFAYFVLTGGRFVYASLARLLVLKFVLSMSASKDVLALASLEVDLSSIEPGTTVTVKWRGKPVFIRRRTEDDINLANSVDISSLRDPQEDAVRVKNPEWLIVIGVCTHLGCIPLPNAGDYGGWFCPCHGSHYDISGRIRKGPAPYNLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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