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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000962`

染色体: Chr05 坐标: 7766507-7769940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000962`
名称	SmilChr05G000962
描述	putative PAP-specific phosphatase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7766507 - 7769940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985676`
GeneID	`130985676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985676`
原始查询	`SmilChr05G000962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative PAP-specific phosphatase, mitochondrial
产物	putative PAP-specific phosphatase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G05090` (AT4G05090) Inositol monophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825853] identity=59.6; qcov=1; evalue=4.17e-169; confidence=high
Rice	`Os07g0558200` - identity=54.5; qcov=0.938; evalue=3.46e-134; confidence=high
GO	GO:0000103 (sulfate assimilation); GO:0008441 (3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00459 (Inositol_P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764737.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057764737.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764737.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7766629`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr5:7766629`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr5:7767022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B23,B89,C76
`Chr5:7767046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B49
`Chr5:7767316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B49,C48
`Chr5:7768333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:7768494`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr5:7768494`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr5:7768530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B87,C22,D9
`Chr5:7768585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C59
`Chr5:7769686`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B100,C36
`Chr5:7769686`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B100,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764737.1

405 aa

202

405

Inositol_P

PF00459 Inositol_P 81-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764737.1`	Pfam	`PF00459`	Inositol_P	Family	81	401	6.1e-30	105.3	Inositol monophosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908754.1
CCCGGGAAAGTTTCAATTGGTAGTACTGGTCTCAAACGCCGTCGTTCCTCCCACGAACAACTATCCAAACATCTGACCGTTGGTTCCCGCTCCCGCCATGGATGTTCTCATCCACTCCGCGGCCTCTCGATTCTCGCTGCGTCTACACCGCCGCGCATCTCTCCGCCAATGTGCCCTCTCCGCGAGGTCGCAGTTGAGCCTTCCTTTCGCGGAGCAGAAAGCAAAGTACTATGAGCATCTCCAAGCGGCTGTTGATGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985676
ATGGATGTTCTCATCCACTCCGCGGCCTCTCGATTCTCGCTGCGTCTACACCGCCGCGCATCTCTCCGCCAATGTGCCCTCTCCGCGAGGTCGCAGTTGAGCCTTCCTTTCGCGGAGCAGAAAGCAAAGTACTATGAGCATCTCCAAGCGGCTGTTGATGTGGTTGAGCGCGCCTGCCATCTCTGCGTTGACGTGCAAAAGTCATTGTTTTCGAGTGATGGAAATATCATTGAGAAAATCGACCAGACACCGGTCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764737.1
MDVLIHSAASRFSLRLHRRASLRQCALSARSQLSLPFAEQKAKYYEHLQAAVDVVERACHLCVDVQKSLFSSDGNIIEKIDQTPVTVADFGVQALVSLEMSKLFPSIPLVAEEDSGFVRENNLAGAVFAEVTEKSSISDKELSEEDVLKAIDRGGKDAYVFGPEPTTYWILDPIDGTRGFVKGSEALYVVGLALVVKGEIVLGVMGCPNWQERDSDISNTDGAEENVSRSGIIMISHVGCGTWSTRLWDWPNSNFKMACK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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