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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001026`

染色体: Chr05 坐标: 8413681-8414710 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001026`
名称	SmilChr05G001026
描述	DNA repair protein RAD50-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8413681 - 8414710 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985737`
GeneID	`130985737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985737`
原始查询	`SmilChr05G001026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair protein RAD50-like
产物	DNA repair protein RAD50-like
Arabidopsis	`AT2G31970` (RAD50) DNA repair-recombination protein (RAD50) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817756] identity=93; qcov=0.74; evalue=2.35e-32; confidence=medium
Rice	`Os02g0497500` (Rad50) - identity=93; qcov=0.74; evalue=1.02e-32; confidence=medium
GO	GO:0000722 (telomere maintenance via recombination); GO:0000794 (condensed nuclear chromosome); GO:0003691 (double-stranded telomeric DNA binding); GO:0006302 (double-strand break repair); GO:0007004 (telomere maintenance via telomerase); GO:0030870 (Mre11 complex); GO:0032508 (GO:0032508); GO:0043047 (single-stranded telomeric DNA binding); GO:0051880 (G-quadruplex DNA binding); GO:0070192 (chromosome organization involved in meiotic cell cycle); GO:0090305 (GO:0090305)
KEGG	-
Pfam	PF13558 (SbcC_Walker_B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057764825.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764826.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057764827.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764825.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8413874`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A6,B10,B110,B112,B114,B123,B125,B129,B130,B133,B135,B22,B42,B43,B45,B67,B81,B84,B96,B97,C1,C14,C22,C29,C30,C43,C46,C5,C58,C68,C7,C73,C76,D10,D11,D7,D8
`Chr5:8413879`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C12,C15,C21
`Chr5:8413879`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C12,C15,C21
`Chr5:8414353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C13,D11
`Chr5:8414356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764825.1

91 aa

SbcC_Walker_B

PF13558 SbcC_Walker_B 9-75 aa

XP_057764826.1

88 aa

SbcC_Walker_B

PF13558 SbcC_Walker_B 12-72 aa

XP_057764827.1

77 aa

SbcC_Walker_B

PF13558 SbcC_Walker_B 8-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764825.1`	Pfam	`PF13558`	SbcC_Walker_B	Domain	9	75	1.9e-06	28.7	SbcC/RAD50-like, Walker B motif
`XP_057764826.1`	Pfam	`PF13558`	SbcC_Walker_B	Domain	12	72	2.9e-06	28.2	SbcC/RAD50-like, Walker B motif
`XP_057764827.1`	Pfam	`PF13558`	SbcC_Walker_B	Domain	8	61	4.7e-06	27.5	SbcC/RAD50-like, Walker B motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908844.1
TCTCCTTAGTGGATGAAGTGCATCAGCAACTTAATACTTGATAATCGTGTCACTACATCTTAATGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATTGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCCAACTCCGAGTCTTGCAGCAGCTTTACTTATG...

XM_057908842.1
CCTTAGTGGATGAAGTGCATCAGCAACTTAATACTTGATAATCGTGTCACTACATCTTAATGTATTCTAGTTCAATGTTGCTTAATGTATATTTGGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATTGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985737
ATGTATTCTAGTTCAATGTTGCTTAATGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATTGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCCAACTCCGAGTCTTGCAGCAGCTTTACTTATGGGTCCAACCTATGGTTACAGGGGAAAGGTGTTGCTTG...

LOC130985737
ATGTATTCTAGTTCAATGTTGCTTAATGTATATTTGGTGTTAATGCAAACTGGTGATGCACAACTAGAAATGAGAGGAAGGTGTAGTGTCGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCACTTATCATAAGATTGGCAGTAGCGGAAACCTTTTGCCTTAATTGCGGAATACTTGCACTGGATGAACCAACCACAAACTTGGATGGCCCCAACTCCGAGTCTTGCAGCAGCTTTACTTATGGGTCCAACCTATGGTTACAGGGGAAAGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764825.1
MYSSSMLLNVYLVLMQTGDAQLEMRGRCSVGQKVLASLIIRLAVAETFCLNCGILALDEPTTNLDGPNSESCSSFTYGSNLWLQGKGVACF

XP_057764826.1
MYSSSMLLNVLMQTGDAQLEMRGRCSVGQKVLASLIIRLAVAETFCLNCGILALDEPTTNLDGPNSESCSSFTYGSNLWLQGKGVACF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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