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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001033`

染色体: Chr05 坐标: 8471070-8472693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001033`
名称	SmilChr05G001033
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 8
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8471070 - 8472693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985762`
GeneID	`130985762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985762`
原始查询	`SmilChr05G001033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 8
产物	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 8
Arabidopsis	`AT1G11545` (XTH8) xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837698] identity=73.5; qcov=0.958; evalue=7.26e-167; confidence=high
Rice	`Os11g0539200` (OsXTH2) - identity=48.3; qcov=0.85; evalue=1.22e-86; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057764863.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764863.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057764863.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764863.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8471401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B140,B23,B74
`Chr5:8471536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B136,B35
`Chr5:8471675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B136,B94
`Chr5:8471759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:8471937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B89,C25,C53,C76
`Chr5:8472222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C76
`Chr5:8472248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B91,C20,C58
`Chr5:8472316`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A11,A16,A22,A3,B109,B11,B110,B113,B120,B124,B129,B139,B15,B18,B30,B37,B38,B39,B45,B46,B50,B52,B6,B60,B65,B68,B69,B70,B76,B78,B80,B85,B91,B99,C16,C19,C21,C27,C29,C31,C33,C35,C37,C39,C48,C54,C63,C7,C76,C8,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764863.1

307 aa

154

307

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 45-226 aa PF06955 XET_C 254-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764863.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	45	226	9.3e-57	192.0	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057764863.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	254	301	7e-16	58.5	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908880.1
GAACTCGATCCAACCATTCTTTACTGCAAGAAAAGTGCAACACTTAAATAACCGATGTAGATCTATTGTGTCTGTCCTCAACAATTCCAGTTGTCAAACCCAAGAACTTTCTGATTAATATAAACACCAATCAAATGTCCTCACGTTCTTTCATGCAACATGTTGGCCACAACCCCACCTTTTTATTCTTCACTATCAAATTTAAATGTTTCCATTGGAATTTCTACTCTCGGTATAACAGTGAAACTTTTCCAAATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985762
ATGAAAGCATCCCTGTTTCCGAGAGGCTCGAAAATGGAGAGAAGCGCTATTTTGTCGGCCGCATTTCTGGTGGGCGTCATCGTCACCACTCCATTTTCACGGGCAGCTGACCTGAAAGGCTCGTTCGATGATAACTTCAGCAAAAGCTGCCCGGCAAAGAACTTCAAGACTTCTGAAGACGGGCAGATCTGGCACCTATCCCTCGATGAAGATGCAGGTTGCGGGTTTATGACGAAAGAGAAATACAGATTCGGGTGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764863.1
MKASLFPRGSKMERSAILSAAFLVGVIVTTPFSRAADLKGSFDDNFSKSCPAKNFKTSEDGQIWHLSLDEDAGCGFMTKEKYRFGWFSMKLKLVGGDSAGVVTAYYMCSENAAGPERDEVDIEFLGNRTGQPYVIQTNVYKNGTGGREMRHSLWFDPTEDFHTYSILWNNHQLVWFVDAVAVRVYKNANYSNNFFPNEKAMYLFSSIWNADDWATRGGLEKTDWKKAPFVSSYKEFKAEGCKWEDPYPACVATTTEHWWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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