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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001035`

染色体: Chr05 坐标: 8495902-8497432 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001035`
名称	SmilChr05G001035
描述	thiamine thiazole synthase 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8495902 - 8497432 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985758`
GeneID	`130985758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985758`
原始查询	`SmilChr05G001035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiamine thiazole synthase 2, chloroplastic
产物	thiamine thiazole synthase 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G54770` (THI1) thiazole biosynthetic enzyme, chloroplast (ARA6) (THI1) (THI4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835567] identity=80.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0529600` (OsDR8) - identity=74.4; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009228 (thiamine biosynthetic process)
KEGG	smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01946 (Thi4); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764859.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764859.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057764859.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764859.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8496296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B82,B9,C44
`Chr5:8496329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:8496560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B23
`Chr5:8496590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B23
`Chr5:8496605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B21,B37
`Chr5:8496611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B30,B78,C31
`Chr5:8496773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:8497271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764859.1

347 aa

174

347

Thi4

FAD_binding_2

DAO

NAD_binding_8

PF01946 Thi4 68-301 aa PF00890 FAD_binding_2 86-122 aa PF01266 DAO 86-135 aa PF13450 NAD_binding_8 89-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764859.1`	Pfam	`PF01946`	Thi4	Family	68	301	6.1e-114	379.8	Thi4 family
`XP_057764859.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	86	122	4.4e-09	36.8	FAD binding domain
`XP_057764859.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	86	135	1.9e-08	34.9	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057764859.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	89	124	5.7e-07	30.4	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908876.1
AAACGACACAGTTTAATGGCTGCACAGCACACTGCTATGCAAGGGCAGTAGAGGATCGTATCCCGCAGAGGCATTGTGAATCGTTCAAATTTTATCTTCGTCGCACTTTAATTTAACCCCACACACCTTGAGATCTTTTCTCCTTGATTTTTTTAGCTGTGGATCGTTTCCGCCATATATATTCACACACGCTCCTCATCAACAATTATCAATAATCCTCACTCAACACTACCTCTTTCTCTCTCTCAAATAAACTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985758
ATGGCAGCCATGGCCACAACCCTCACCTCCTCCCTCTCTAAAACCCAGTTCTTCGACAACAAGTCCTCCTTCCATGGCTCCCCCGTGGCAACACGCGCCGCCCAGCCCCTGAAATCCGCCCCCCAGAGCCTCTCAGTGACCATGTCCGCCGCCTACGACCTGGACAACTTCAAATTCCAGCCGATCAAGGAGTCAGTGGTCTCCCGCGAGATGACGAGGAGATACATGACGGACATGATCACCTACGCCGACACCGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764859.1
MAAMATTLTSSLSKTQFFDNKSSFHGSPVATRAAQPLKSAPQSLSVTMSAAYDLDNFKFQPIKESVVSREMTRRYMTDMITYADTDVVVVGAGSAGLSCAYELSKNPNINIAIIEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMVVRKPAHRFLDELEIEYDEQDDYVVIKHAALFTSTIMSKLLARPNVKLFNAVAAEDLIVKGGRVGGVVTNWALVSMNHDTQSCMDPNVMEAKIVVSSCGHDGPFGATGVKRLKSIGMIDSVPGMKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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