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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001109`

染色体: Chr05 坐标: 9206927-9212335 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001109`
名称	SmilChr05G001109
描述	aspartic proteinase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9206927 - 9212335 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985816`
GeneID	`130985816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985816`
原始查询	`SmilChr05G001109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase-like
产物	aspartic proteinase-like
Arabidopsis	`AT1G11910` (APA1) aspartic proteinase A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837740] identity=74.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0567100` (Oryzasin) - identity=71.2; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0006629 (lipid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF03489 (SapB_2); PF05184 (SapB_1); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057764938.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057764938.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764938.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9207270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:9208572`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:9208572`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9208573`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:9208573`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:9208612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:9208976`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr5:9208976`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr5:9209050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:9210235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:9210274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:9211364`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B4,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764938.1

513 aa

256

513

Asp

TAXi_N

SapB_2

SapB_1

PF00026 Asp 89-512 aa PF14543 TAXi_N 90-248 aa PF03489 SapB_2 323-356 aa PF05184 SapB_1 386-422 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764938.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	89	512	8.2e-118	394.1	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057764938.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	90	248	6.1e-13	50.0	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057764938.1`	Pfam	`PF03489`	SapB_2	Family	323	356	1.3e-12	48.3	Saposin-like type B, region 2
`XP_057764938.1`	Pfam	`PF05184`	SapB_1	Domain	386	422	3.4e-14	53.2	Saposin-like type B, region 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908955.1
TTATCGACGGCTGCGATTTTCGGAAAACTGTAGCTCTCTCTCAAAAATCAAAATATATTTCGGTTCTCTTATATATTCACCACCCTCCTCCCATTCATCTCTTTCTTCACTGCTACCTTCTCAGATTGGTTTTGATCTCGTCTGTCTTCAACGTTTCGGGAAAATGGGAACCAGACTTAAAGCTGTTGCTGTCACCTTTTTCCTTTCAAGCCTGTTCTTTTCTCTTGCATTTTCTGCATCGGATGATGGATTGCTAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985816
ATGGGAACCAGACTTAAAGCTGTTGCTGTCACCTTTTTCCTTTCAAGCCTGTTCTTTTCTCTTGCATTTTCTGCATCGGATGATGGATTGCTAAGAATAGGACTAAAAAAGTTGAAGTTTGATCAAAACAATCGACTAGCTGCTGGGCTTGAGTCTAAAGAAGCAGAAAAATTGAGAGCTTCAATTAGGAAGTATAGTTTCCGAGGTAAACTTAGTGAGTCTGCAGATACTGACATTGTTGCGCTGAAGAACTACATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764938.1
MGTRLKAVAVTFFLSSLFFSLAFSASDDGLLRIGLKKLKFDQNNRLAAGLESKEAEKLRASIRKYSFRGKLSESADTDIVALKNYMDAQYFGEIGIGTPPQKFTVIFDTGSSNLWVPSSKCYFSVPCFFHSKYKSSQSSTYRKNGKSAAIQYGTGAISGFFSEDNVKVGHLVVKNQEFIEATREPGVTFLVAKFDGILGLGFKEISVGNATPVWYNMVKQGLVKEPVFSFWLNRNLKDEEGGELIFGGVDPNHYIGKHSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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