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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001120`

染色体: Chr05 坐标: 9338724-9343085 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001120`
名称	SmilChr05G001120
描述	ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9338724 - 9343085 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985825`
GeneID	`130985825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985825`
原始查询	`SmilChr05G001120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinol oxidase 4, chloroplastic/chromoplastic
产物	ubiquinol oxidase 4%2C chloroplastic/chromoplastic
Arabidopsis	`AT4G22260` (IM) Alternative oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828321] identity=75.2; qcov=0.741; evalue=1.27e-132; confidence=high
Rice	`Os04g0668900` (IM1) - identity=66.1; qcov=0.782; evalue=9.17e-112; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009579 (thylakoid); GO:0009916 (alternative oxidase activity); GO:0010230 (alternative respiration)
KEGG	-
Pfam	PF01786 (AOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764952.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057764952.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057764952.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764952.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057764952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9338982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:9338990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A22,B115,B139,C79
`Chr5:9339599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C53
`Chr5:9339689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:9341626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:9342259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C61
`Chr5:9342573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764952.1

366 aa

183

366

AOX

PF01786 AOX 133-318 aa

XP_057764953.1

364 aa

182

364

AOX

PF01786 AOX 131-316 aa

XP_057764955.1

321 aa

160

321

AOX

PF01786 AOX 133-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764952.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	133	318	4.3e-39	135.1	Alternative oxidase
`XP_057764953.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	131	316	4.3e-39	135.1	Alternative oxidase
`XP_057764955.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	133	272	3.8e-32	112.4	Alternative oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908970.1
GACGACGGTAAATATCTCGATCTAATATGGACAAAATTTAGTATATTCCGAGGTGTCAACTGTCACCCCCCATATTCAGATCATATTATACACGTCTGACGTCTCCTCGCTGTTTCTTTAACTGAGCTATACTTATTTAGGTTGCAAATTTGCTGTTTGCTTCGCACCCGCGAAAAACTCGCCGTTTTAATTGCTCCGCCACTTTACATGAGCAAGCTTATATAGAGGCATAAGGGAAGAAGCAAGGAATGGCGAATTCC...

XM_057908972.1
TTCCGAGGTGTCAACTGTCACCCCCCATATTCAGATCATATTATACACGTCTGACGTCTCCTCGCTGTTTCTTTAACTGAGCTATACTTATTTAGGTTGCAAATTTGCTGTTTGCTTCGCACCCGCGAAAAACTCGCCGTTTTAATTGCTCCGCCACTTTACATGAGCAAGCTTATATAGAGGCATAAGGGAAGAAGCAAGGAATGGCGAATTCCATTTCTCCCCTCCACTTTTCACGAATTTTAATTTCGCCGCCCTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985825
ATGGCGAATTCCATTTCTCCCCTCCACTTTTCACGAATTTTAATTTCGCCGCCCTTTCTCCTGAAATCGAACGGTTTGGGAGTTTCTTCTGTTTTATGCAATTCTGCAAACCCTCTTCGTCTGTGTTTGGATTCCGGTCATCGCTCTGCTTCGCGACCACGGCCCAGTAAAAGGTTGGTTAGAGTTCTAGCTAAAATATTGCAAGAGGATGAAGAAAAAGTGGTCGTGGAGAAATCATTTAATCCAAAAGGTTTCCCAGA...

LOC130985825
ATGGCGAATTCCATTTCTCCCCTCCACTTTTCACGAATTTTAATTTCGCCGCCCTTTCTCCTGAAATCGAACGGTTTGGGAGTTTCTTCTGTTTTATGCAATTCTGCAAACCCTCTTCGTCTGTGTTTGGATTCCGGTCATCGCTCTGCTTCGCGACCACGGCCCAGGTTGGTTAGAGTTCTAGCTAAAATATTGCAAGAGGATGAAGAAAAAGTGGTCGTGGAGAAATCATTTAATCCAAAAGGTTTCCCAGAAAAGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764952.1
MANSISPLHFSRILISPPFLLKSNGLGVSSVLCNSANPLRLCLDSGHRSASRPRPSKRLVRVLAKILQEDEEKVVVEKSFNPKGFPEKEKEGTSGSLPSDGSPSSSGLEKWTIKLEQSINILLTDSVIKILDTLYHDRDYARFYVLETIARVPYFAFMSVLHMYESFGWWRRADYLKVHFAESWNEMHHLLIMEELGGNSWWVDRFLAQHIAVFYYFMTVFMYALSPRMAYHFSECVESHAFETYDKFIKSQGDELKRLP...

XP_057764953.1
MANSISPLHFSRILISPPFLLKSNGLGVSSVLCNSANPLRLCLDSGHRSASRPRPRLVRVLAKILQEDEEKVVVEKSFNPKGFPEKEKEGTSGSLPSDGSPSSSGLEKWTIKLEQSINILLTDSVIKILDTLYHDRDYARFYVLETIARVPYFAFMSVLHMYESFGWWRRADYLKVHFAESWNEMHHLLIMEELGGNSWWVDRFLAQHIAVFYYFMTVFMYALSPRMAYHFSECVESHAFETYDKFIKSQGDELKRLPAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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