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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001261`

染色体: Chr05 坐标: 10747485-10750642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001261`
名称	SmilChr05G001261
描述	subtilisin-like protease SBT5.4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10747485 - 10750642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985957`
GeneID	`130985957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985957`
原始查询	`SmilChr05G001261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT5.4
产物	subtilisin-like protease SBT5.4
Arabidopsis	`AT5G59810` (SBT5.4) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836102] identity=60.5; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0479900` (OsSub58) - identity=55.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057765175.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057765175.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765175.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765175.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10747619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B65,B91
`Chr5:10747821`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B27,B42,B43,B6,C30,C48,C57,C67
`Chr5:10748598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B53
`Chr5:10748604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B55,B98,C10,C28
`Chr5:10748628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:10748674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B53
`Chr5:10748682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:10748704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:10748733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:10748799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:10748890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C18,C29
`Chr5:10748988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765175.1

767 aa

384

767

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 31-115 aa PF00082 Peptidase_S8 143-595 aa PF02225 PA 395-470 aa PF17766 fn3_6 668-761 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765175.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	31	115	9.7e-16	58.9	Peptidase inhibitor I9
`XP_057765175.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	143	595	4.4e-39	135.2	Subtilase family
`XP_057765175.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	395	470	7.3e-15	55.6	PA domain
`XP_057765175.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	668	761	7.8e-27	94.1	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909192.1
TGCAAAACAAGGAAGAGAGAGTGAGGAAAGAGAGAGATCAGTGCTTAAAATTTAAACACGATACATAATATAAAGTGTATGTCCCTTTTTTAAAGTGACAAAAGCAGATCAAAGATGTTATTTGGCAAGATTTTGCCAACTTTTGTGGCACTATTCATTCTTTTTGCTGTATTCCACCAACCAGCTTTAGCCACAAAAAAGGCCTATGTTGTCTACTTGGGAGCACATTCTCATGGCCCAGAACCAACATCTGCTGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985957
ATGTTATTTGGCAAGATTTTGCCAACTTTTGTGGCACTATTCATTCTTTTTGCTGTATTCCACCAACCAGCTTTAGCCACAAAAAAGGCCTATGTTGTCTACTTGGGAGCACATTCTCATGGCCCAGAACCAACATCTGCTGATCTTCACCGAGTTACCACCTCTCACACTCAGTTGCTATCATCATTTCTAGGAAGTGAAGATAAGGCTGAAGATGCACTAATCCACTCTTATGAAAGGCACATTAATGGCTTCTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765175.1
MLFGKILPTFVALFILFAVFHQPALATKKAYVVYLGAHSHGPEPTSADLHRVTTSHTQLLSSFLGSEDKAEDALIHSYERHINGFSAFLEEEEAAEIAKQAGVVSVFLNQGKKLHTTHSWDFLRVENNGVIEASSIWKKARFGEDTIIANLDTGVWPESKSFSGQGYGPIPSKWKGICQFNQSLCNRKLIGARYFIKGYEAYTGKQDPSMHNPRDTEGHGSHTLSTAGGNMVAGASVFGIGNGTAKGGSPRARVATYKIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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