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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001273`

染色体: Chr05 坐标: 10878000-10885962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001273`
名称	SmilChr05G001273
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP59
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10878000 - 10885962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985971`
GeneID	`130985971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985971`
原始查询	`SmilChr05G001273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP59
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP59
Arabidopsis	`AT1G53720` (CYP59) cyclophilin 59 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841810] identity=67.5; qcov=0.833; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0670500` (OsCYP59b) - identity=56.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC); PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765205.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057765205.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765205.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765205.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10878283`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr5:10878283`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr5:10878285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B73
`Chr5:10878285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:10878376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B120,C3
`Chr5:10878385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:10878393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8
`Chr5:10878415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:10878557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:10878728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:10878735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C58
`Chr5:10879407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B82,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765205.1

576 aa

288

576

Pro_isomerase

RRM_1

zf-CCHC

PF00160 Pro_isomerase 5-159 aa PF00076 RRM_1 245-315 aa PF00098 zf-CCHC 340-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765205.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	5	159	1.8e-45	155.8	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057765205.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	245	315	1.7e-15	57.4	RNA recognition motif
`XP_057765205.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	340	354	9.5e-05	23.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909222.1
ATTGCTCTAATCTTCTCTAGCGACTCCAACTTCTATATAGCCTTGATGGCTTCATTAGAATTTTTAACCAACAAAGGCTCAAACTAGAAATGATTCGACCCCATCAAAAATGAAGATTCACAATCTAAAGAAAAGCCCAATAGTGCCTTCTTCATTTCTTGCAACCAACAAAGATTCAAACTAGCCTTCAGTTAATCTAAAGAAAAGCCCAATAAAATATCTAAGACCCATTTCGTTTATTAAAGATTCACTAACAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985971
ATGTCGGTTATGCTAGTAACGAGTTTGGGAGAGATTGTGATGGATTTGTTCACTGATCGTTGCCCCTTGACCTGCAAGAATTTTCTCAAGCTCTGCAAAATCAAGTACTATAATGGATGCCTCTTTCACACAATACAAAAAGATTTTACTGCACAGACAGGTGATCCGACAGGGACGGGATCTGGTGGTGATTCTGTGTACAAATTCTTATACGGTGACCAAGCTCGGTTTTTTGGCGATGAAATACACCTGGATGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765205.1
MSVMLVTSLGEIVMDLFTDRCPLTCKNFLKLCKIKYYNGCLFHTIQKDFTAQTGDPTGTGSGGDSVYKFLYGDQARFFGDEIHLDVKHSKIGTLAMASAGENLNASQFYITLREDIDYLDGKHTVFGEVAEGLETLTRINEAYVDEKNRPYKNIRIKHTYIIDDPFEDPPLLAELIPDTSPEGKPKDEVEDDVRLEDDWIPMDEQLNPQELQEVLREKAAHTSAVLLETIGDIPQAEMKPPENVLFVCKLNPVTEDDDLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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