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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001453`

染色体: Chr05 坐标: 13270434-13275101 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001453`
名称	SmilChr05G001453
描述	uncharacterized SmilChr05G001453
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13270434 - 13275101 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986144`
GeneID	`130986144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986144`
原始查询	`SmilChr05G001453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase I subunit 43 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842356]; symbol=RPAC43; hit=AT1G60620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA polymerase I subunit 43 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842356]; symbol=RPAC43; hit=AT1G60620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G60620` (RPAC43) RNA polymerase I subunit 43 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842356] identity=70.5; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0295400` - identity=65.8; qcov=0.951; evalue=5.01e-175; confidence=high
GO	GO:0001054 (GO:0001054); GO:0001056 (GO:0001056); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01000 (RNA_pol_A_bac); PF01193 (RNA_pol_L)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765418.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057765418.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057765418.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057765418.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13270915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C28,C29,C33
`Chr5:13271219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B126,B62
`Chr5:13271517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13273311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:13273638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:13273790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13274624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,C18,C28,C29,C33
`Chr5:13274840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765418.1

384 aa

192

384

RNA_pol_L

RNA_pol_A_bac

PF01193 RNA_pol_L 90-376 aa PF01000 RNA_pol_A_bac 134-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765418.1`	Pfam	`PF01193`	RNA_pol_L	Domain	90	376	2.6e-24	85.5	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain
`XP_057765418.1`	Pfam	`PF01000`	RNA_pol_A_bac	Domain	134	266	1.3e-13	51.9	RNA polymerase Rpb3/RpoA insert domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909435.1
ACAACTAAAATCAAAATCAACATATTATTCTAAAAACCCTAAACCTAAAGCCCTAAAAATATATCGCAGCTTCCTCCTTCCCACACGACGAGCAGGAAACAATCTTACAGAAAAGATGGTTTCAGAGTCTGAAAACAGTGAAGAGCAAAAAACAGAGAAAATTCCGGTGTGGGATTTGCCTGATGTCCCCAAAGGAGAGCTGCCGCCGCACATTCAACTTCAGAGGACTCGTGTTCTTTGCACTTTCGATGCCCCAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986144
ATGGTTTCAGAGTCTGAAAACAGTGAAGAGCAAAAAACAGAGAAAATTCCGGTGTGGGATTTGCCTGATGTCCCCAAAGGAGAGCTGCCGCCGCACATTCAACTTCAGAGGACTCGTGTTCTTTGCACTTTCGATGCCCCAACTCACACGGAGAACATACGATACTCGGGTGCTTATGCGGCAATGGGAGTGGATAACAGTTTAAGACTCGCGGAATTCCGGAACAATTTTAAGGTGGAAGTGATTAAACTCACGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765418.1
MVSESENSEEQKTEKIPVWDLPDVPKGELPPHIQLQRTRVLCTFDAPTHTENIRYSGAYAAMGVDNSLRLAEFRNNFKVEVIKLTEDDMEFDMIGIDASIANAFRRILIAELPTMAIEKVFVANNTSVVQDEVLAHRLGLVPLKVDPRHFNYISENDEPNEKNTIVFKLHVRCEKGAPRIKVKSDELKWLPNGSEFVLSAEKSNPDSTAKAKTYTSFSSSQDSLPEFVNNPIAPKHDDIILAKLGPKQEIELEAHAVKGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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