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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001542`

染色体: Chr05 坐标: 14125695-14128091 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001542`
名称	SmilChr05G001542
描述	V-type proton ATPase subunit e1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14125695 - 14128091 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986235`
GeneID	`130986235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986235`
原始查询	`SmilChr05G001542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit e1
产物	V-type proton ATPase subunit e1
Arabidopsis	`AT5G55290` (AT5G55290) ATPase, V0 complex, subunit E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835622] identity=88.6; qcov=1; evalue=1.24e-40; confidence=medium
Rice	`Os04g0660600` - identity=76.1; qcov=0.957; evalue=8.27e-33; confidence=medium
GO	GO:0033179 (proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05493 (ATP_synt_H)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765558.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057765558.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057765558.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765558.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14127040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765558.1

70 aa

ATP_synt_H

PF05493 ATP_synt_H 3-67 aa

XP_057765559.1

70 aa

ATP_synt_H

PF05493 ATP_synt_H 3-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765558.1`	Pfam	`PF05493`	ATP_synt_H	Family	3	67	3.9e-22	79.2	ATP synthase subunit H
`XP_057765559.1`	Pfam	`PF05493`	ATP_synt_H	Family	3	67	3.9e-22	79.2	ATP synthase subunit H

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909575.1
TGTCCGATATTGAATTTGGGCTGCATTGGGATATACGTATAATAAGCCCATTACATTTTAGTCACTTTTTTTATTAAAAAATTGAAGCCCAATCTATTGAGTAACATGTTGGAATTTTGATGCAATTTGGTTATTCCCCGATTTGCTGCAACAGATTGATTATTGAATTTCAATCTTATCAAACCGACGCCGGATCGAGCACTCCCCTTCACCGGAAGATTCCGCCGGTTTCCGGAATTCAAGGTAAAAGCGTTTATTAT...

XM_057909576.1
ATCTATTGAGTAACATGTTGGAATTTTGATGCAATTTGGTTATTCCCCGATTTGCTGCAACAGATTGATTATTGAATTTCAATCTTATCAAACCGACGCCGGATCGAGCACTCCCCTTCACCGGAAGATTCCGCCGGTTTCCGGAATTCAAGTAAATTATATTCTCTTCGCAGGTAAAAGCGTTTATTATAACTAACTGTCTTTGGGAAAAGCATCGGAGATGGGGTTTCTGGTGACTACTTTGATCTTCGTAGTGGTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986235
ATGGGGTTTCTGGTGACTACTTTGATCTTCGTAGTGGTTGGGGTAATTGCATCATTGTTAACCAGAATCTGCTGCAACAGAGGGCCCTCCGCAAACCTGTTACATCTGACATTGGTTATTACAGCGACAGTTTGCTGTTGGATGATGTGGGCAATTGTATACTTGGCACAGATGAACCCTCTGATTGTTCCCATATTGAATGAAGCGGAATGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765558.1
MGFLVTTLIFVVVGVIASLLTRICCNRGPSANLLHLTLVITATVCCWMMWAIVYLAQMNPLIVPILNEAE

XP_057765559.1
MGFLVTTLIFVVVGVIASLLTRICCNRGPSANLLHLTLVITATVCCWMMWAIVYLAQMNPLIVPILNEAE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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