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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002090`

染色体: Chr05 坐标: 21883501-21885001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002090`
名称	SmilChr05G002090
描述	peroxidase 72
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21883501 - 21885001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986719`
GeneID	`130986719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986719`
原始查询	`SmilChr05G002090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 72
产物	peroxidase 72
Arabidopsis	`AT5G66390` (AT5G66390) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836771] identity=70.4; qcov=0.868; evalue=3.4e-178; confidence=high
Rice	`Os01g0263300` (atp6) - identity=69.3; qcov=0.862; evalue=6e-165; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057766191.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057766191.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766191.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766191.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21883803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:21883834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:21884444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:21884449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B16
`Chr5:21884639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:21884650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:21884658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:21884685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B16,C47
`Chr5:21884864`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A11,A18,A20,A3,B107,B113,B115,B12,B128,B133,B21,B22,B27,B32,B37,B44,B49,B54,B56,B61,B65,B78,B80,B85,B87,B91,B96,B99,C15,C20,C22,C23,C40,C49,C5,C54,C55,C62,C87,D10,D11,D5,D9
`Chr5:21884875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B16,B94
`Chr5:21884914`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	B105,B107,B113,B115,B128,B27,B32,B37,B44,B49,B54,B61,B65,B80,B99,C44,C49,C54,C55,C62,C87,D10,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766191.1

378 aa

189

378

peroxidase

PF00141 peroxidase 93-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766191.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	93	341	7.9e-86	288.4	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910208.1
TCATATACTCTTACACAAATCATATACTTCACATATTATTCTACTTTACATATATATAATAAAAATATTATATTTAAATCTGTATCATGGAGACAGTAACCAATTCAACTCAAAATCCTACCAACTCCAATTACTCTGACTCTGTTTCTCTCAAAAGTAAAGTCTATAAATACTTAAAACACTTGCATCTCCCAAATCATCAAGCAAGCCTTTCCTCAAACACAAACACAAAAATGGCCAACTTAATCTTGATTGTAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986719
ATGGAGACAGTAACCAATTCAACTCAAAATCCTACCAACTCCAATTACTCTGACTCTGTTTCTCTCAAAAGTAAAGTCTATAAATACTTAAAACACTTGCATCTCCCAAATCATCAAGCAAGCCTTTCCTCAAACACAAACACAAAAATGGCCAACTTAATCTTGATTGTAACTACTCTTGTCACAATTGCTCCTCTCTGCTTCTGCCACAGCACAAATGGAGGCTACCTCTACCCACAATTCTACGACCGGTCATGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766191.1
METVTNSTQNPTNSNYSDSVSLKSKVYKYLKHLHLPNHQASLSSNTNTKMANLILIVTTLVTIAPLCFCHSTNGGYLYPQFYDRSCPQALPIVKSIVAKAVAREPRMAASLLRLHFHDCFVKGCDASILLDSGGGLTSEKNSVPNRNSVRGFDVIDEIKSAVEKACPQTVSCADILAVAARDSTVVAGGPSWVVPLGRRDSKGASLSGSNHNIPAPNNTFQTILTKFKLQGLNIVDLVALSGSHTIGKARCTSFRQRLYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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