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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002187`

染色体: Chr05 坐标: 23357536-23363109 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002187`
名称	SmilChr05G002187
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23357536 - 23363109 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986797`
GeneID	`130986797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986797`
原始查询	`SmilChr05G002187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 4
产物	actin-related protein 2/3 complex subunit 4
Arabidopsis	`AT4G14147` (ARPC4) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770404] identity=95; qcov=0.904; evalue=4.21e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0848300` - identity=93.6; qcov=0.904; evalue=2.49e-96; confidence=high
GO	GO:0005885 (Arp2/3 protein complex); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0030041 (actin filament polymerization); GO:0034314 (Arp2/3 complex-mediated actin nucleation); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil05100 (Bacterial invasion of epithelial cells - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05856 (ARPC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766322.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057766322.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766323.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766322.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057766322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23360177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:23362261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B44,D5
`Chr5:23362276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B103,B19,B4,B44,B47,C6,C73,C9
`Chr5:23362288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766322.1

169 aa

169

ARPC4

PF05856 ARPC4 1-167 aa

XP_057766323.1

156 aa

156

ARPC4

PF05856 ARPC4 1-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766322.1`	Pfam	`PF05856`	ARPC4	Family	1	167	2.2e-81	272.1	ARP2/3 complex 20 kDa subunit (ARPC4)
`XP_057766323.1`	Pfam	`PF05856`	ARPC4	Family	1	141	1.6e-69	233.5	ARP2/3 complex 20 kDa subunit (ARPC4)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910339.1
AGCGGAGGACTGTAGTCGTTCAGCTGTTATCCTTAGGTCGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGATATTTTTTCAACTTTTTTTATTTAATTTTTTTAGCTTTTAAAAAAACTATGCATATTCCATATAAAAAAAAAACACATTATGTGTATATATTAGTAATATTACTTATTTTATTTTTGATAAAAAGTTTACCAAACAAAGACGAATATTGAGCAAACAAACTCAAAATTTATTCAACAATCATCAGCCGAAAAATCC...

XM_057910340.1
GTATATATTAGTAATATTACTTATTTTATTTTTGATAAAAAGTTTACCAAACAAAGACGAATATTGAGCAAACAAACTCAAAATTTATTCAACAATCATCAGCCGAAAAATCCAAGATCCGTCATTACATTGACCCTTTTTCAGATCGCGCGATTATGGCGAACTCATTGCGATTGTACCTAACATGCATTCGGAACACTCTAGAGGCCGCCTTGTGCTTGCAGAATTTTCCCTGTCAAGAAGTGGAAAGGCACAATAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986797
ATGGCGAACTCATTGCGATTGTACCTAACATGCATTCGGAACACTCTAGAGGCCGCCTTGTGCTTGCAGAATTTTCCCTGTCAAGAAGTGGAAAGGCACAATAAACCAGAAGTTGAACTCAAGACCAGTCCAGAGCTTCTACTGAATCCAGTTCTGATATGTAGAAATGAAGCCGAGAAATGTTTGATAGAAACATCTATAAATTCGTTGCGTATAAGCCTTAAGGTTAAGCAAGCAGATGAACTTGAGAACATACTGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766322.1
MANSLRLYLTCIRNTLEAALCLQNFPCQEVERHNKPEVELKTSPELLLNPVLICRNEAEKCLIETSINSLRISLKVKQADELENILTKKFLRFLSMRAEAFQVLRRKPVQGYDISFLITNYHCEDMQKQKLIEFIVQFMEDIDKEISELKLSVNTRGRLVATEFLKQFI

XP_057766323.1
MANSLRLYLTCIRNTLEAALCLQNFPCQEVERHNKPEVELKTSPELLLNPVLICRNEAEKCLIETSINSLRISLKVKQADELENILTKKFLRFLSMRAEAFQVLRRKPVQGYDISFLITNYHCEDMQKQKLIEFIVQFMEENWLGICAFLFWLHRT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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