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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002318`

染色体: Chr05 坐标: 24994515-24996623 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002318`
名称	SmilChr05G002318
描述	GRAS family protein RAM1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24994515 - 24996623 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024222`
GeneID	`131024222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024222`
原始查询	`SmilChr05G002318`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmGRAS5` P014; 2025	`KY435890`	`LOC131024222` `SmilChr05G002318` GeneID 131024222	nucleotide; identity 99.232%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI
`SmGRAS5` P024; 2025	`KY435890`	`LOC131024222` `SmilChr05G002318` GeneID 131024222	nucleotide; identity 99.232%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRAS family protein RAM1-like
产物	GRAS family protein RAM1-like
Arabidopsis	`AT3G03450` (RGL2) RGA-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821251] identity=28.3; qcov=0.716; evalue=1.94e-46; confidence=low
Rice	`Os03g0707600` (SLR1) - identity=27.6; qcov=0.756; evalue=5.78e-38; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809714.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809714.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24995181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:24995186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:24995384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B33,B68
`Chr5:24995458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B23,C35
`Chr5:24996045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:24996245`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,A3,B10,B113,B132,B17,B19,B21,B28,B49,B7,B79,B80,B84,B94,B97,C14,C5,C6,C60,C73,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809714.1

528 aa

264

528

GRAS

PF03514 GRAS 154-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809714.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	154	524	1.3e-81	275.2	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953731.1
TTATATCAATGATTCATTTCGCCTGCATTGTTTTTGTCGTTGTTGATCTGCCTGTTTTTCTTATGTTTAACTTGCATATAATGTGACAGAATAACATCCTATGTTTTGCTGAAAAGTACAGTTGGATGTATCAGTTTTGATCATTGCCCTTCACTATTAGAAAATATTAAACCCCTTCACATATTTTGCTTTCAACAAGGAATTTGCTTGAGTTATTACAGATCCCTGTTTTCATTTTACTATGTTGAATATAAATATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024222
ATGGAACACAAGAAATCATCAGAAAAAAGTGAAACTGATGGAGTTGAAGCCTGGATGAACAGCTTTGATCTTGCGGATGATGAGATGGTTAAACATCAAATCTACGAACGACAACAGCATCTGCAGGAGTTGGATGATCTGTACCTGGATGTCTTGTCTCCTCCCTTCCAATCATGCGAGGACGAGATGATGAGGCTCATTGGAATCAAGTGCAAGGACACAGAGGTGATTGAGCCTAAGAAGAGTCGAGCAGGCGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809714.1
MEHKKSSEKSETDGVEAWMNSFDLADDEMVKHQIYERQQHLQELDDLYLDVLSPPFQSCEDEMMRLIGIKCKDTEVIEPKKSRAGASPSESFQVLRKYSRRRHLRDDSDKISDMARASFSIEKTIKLAAGKLICAVSEGSNELYNEESSKEVQLVQNLLSCAENVAKKQHERAIRFLNACGEMSSATGTPIQRLAFYLSEALSLKIANEDREKKQHEKKKLVVRHLEPTKCVNSIPIYFKQFPVTQITNLVGSHTILHYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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