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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002432`

染色体: Chr05 坐标: 26817153-26822829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002432`
名称	SmilChr05G002432
描述	uncharacterized SmilChr05G002432
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26817153 - 26822829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026204`
GeneID	`131026204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026204`
原始查询	`SmilChr05G002432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0616900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0616900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30820` (AT1G30820) CTP synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839964] identity=76.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0616900` - identity=77.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003883 (CTP synthase activity); GO:0006241 (CTP biosynthetic process); GO:0019856 (pyrimidine nucleobase biosynthetic process); GO:0042802 (identical protein binding)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00117 (GATase); PF06418 (CTP_synth_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811967.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811967.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811967.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811967.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26818272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B55
`Chr5:26818808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B21
`Chr5:26821015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:26821421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:26821640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B77
`Chr5:26821923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:26821930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:26822140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811967.1

599 aa

300

599

CTP_synth_N

GATase

PF06418 CTP_synth_N 2-272 aa PF00117 GATase 310-543 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811967.1`	Pfam	`PF06418`	CTP_synth_N	Domain	2	272	4.5e-124	413.8	CTP synthase N-terminus
`XP_057811967.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	310	543	1.1e-42	146.6	Glutamine amidotransferase class-I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955984.1
CATCTGAAGACTGACGCTGGAAATTCGTTCTACTATGGGATATAGACATGCCTTTACGGAGTATTAATTAATTTATCTAATATACGAGTGTGACGAGGAAGCAGCGTGGTGTTGAGGTTTTGGGTTTTTGTTAATGATGACGAAGAATCACAAGAAAGGGTTGTGTTGTTGTGCTATAGAACTAGGTTGGTTGGGTGGGTGGGTGAGGGGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGGGAAAAAGAGTGCGTGGGGTGTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026204
ATGAAGTACGTGTTGGTCACCGGAGGAGTCGTCAGCGGCCTTGGCAAAGGCGTCACCGCCAGCAGCATCGGTCTCATCCTCAAGGCCTGCGGACTACGGGTCACTTCCATTAAAATTGATCCTTATCTGAACAGCGATGCTGGTACCATGTCTCCTTTCGAACACGGCGAAGTGTATGTTCTCGATGACGGTGGCGAGGTGGACCTGGACCTTGGAAATTATGAGCGCTTTCTGGATTTAAAATTAACACGAGACAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811967.1
MKYVLVTGGVVSGLGKGVTASSIGLILKACGLRVTSIKIDPYLNSDAGTMSPFEHGEVYVLDDGGEVDLDLGNYERFLDLKLTRDNNITTGKVYQSVIDKERRGDYLGQTVQVVPHITDAIQEWIERAAAIPVDGKDGPADVCVIELGGTIGDIESMPFIEALGQFSYRVGSGNFCLIHVSLVPVLNVVGEQKTKPTQHSVRGLRSLGLTPDILACRSTTELDETVKEKLSRFCHVQRENIITLYDVSNIWRVPLLLRDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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