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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002449`

染色体: Chr05 坐标: 27037086-27040425 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002449`
名称	SmilChr05G002449
描述	vacuolar-sorting receptor 6-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27037086 - 27040425 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026223`
GeneID	`131026223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026223`
原始查询	`SmilChr05G002449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar-sorting receptor 6-like
产物	vacuolar-sorting receptor 6-like
Arabidopsis	`AT1G30900` (VSR6) VACUOLAR SORTING RECEPTOR 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839974] identity=69.2; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0664300` - identity=65.7; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF12662 (cEGF); PF25011 (VSR_TRX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057811988.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057811988.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811988.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057811988.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27037800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:27037993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B17
`Chr5:27038013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C85
`Chr5:27038022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:27038070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:27038235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B78,B93,C23
`Chr5:27038285`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C5
`Chr5:27038285`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C5
`Chr5:27038286`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C5
`Chr5:27038286`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C5
`Chr5:27038418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B79,D7
`Chr5:27038532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C4,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811988.1

627 aa

314

627

VSR_TRX

cEGF

PF02225 PA 57-159 aa PF25011 VSR_TRX 186-393 aa PF12662 cEGF 497-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811988.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	57	159	1.1e-14	55.0	PA domain
`XP_057811988.1`	Pfam	`PF25011`	VSR_TRX	Domain	186	393	2.3e-102	341.8	Vacuolar sorting receptor thioredoxin-like domain
`XP_057811988.1`	Pfam	`PF12662`	cEGF	Domain	497	515	6e-07	29.9	Complement Clr-like EGF-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956005.1
GGCGAACTGAAATAAGTGAATGATCAAAATATAGTACCAAACTTACTTTAGAATGAAGATAAGTGATTAAGAAGCTATATAAGAAATCATTTTAGTGGTAAACGCTAATATACGTTGTATTTTAGCACCAAAACATACAATTTTGGTGTTGTCAAGACTGACGATGTAGAAGAAGAATAGTAGTAATATGTAGAAAGTTAGCCATGGAAATTGATGCTCCGTTGAGCACGTCGTGGTTTGTCCCTTTGTTTACGCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026223
ATGGCTTGTATGTTTGCGGTTGCTTTATTATTATTATTGTCATTAGCAGTGGAATCTCGATTCGTGGTGGAGAAGAGCAGCATCAGCGTGGTGTCTCCTTCCAGTCAGCGGTCGAAACACGACGCTGCCATCGCCAACTTCGGCGTGCCTAACTACGGCGGCTCCTTGACGGGCACTCTGCTTTATCCCGACAAGGCCCAGGTTGGCTGCTCCTCCTTCGACGGCGATAAGCCCTTCAAGCCCCCCAAGTCCTCTCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811988.1
MACMFAVALLLLLSLAVESRFVVEKSSISVVSPSSQRSKHDAAIANFGVPNYGGSLTGTLLYPDKAQVGCSSFDGDKPFKPPKSSRPTILLLDRGECFFALKVWNGQQAGASAVLVADTIDEPLITMDSPQERSPEADGYVEKIGIPSALISRALGDALKEALKNGEDVVLKIDWSESMPHPDERVEYELWTNSNDECGSRCDEQMNFIKNFKGHAQILEKGGFTQFTPHYITWYCPRDFIQTEQCKTQCINRGRYCAPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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