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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002473`

染色体: Chr05 坐标: 27230840-27234502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002473`
名称	SmilChr05G002473
描述	phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27230840 - 27234502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026247`
GeneID	`131026247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026247`
原始查询	`SmilChr05G002473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplastic
产物	phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G21110` (PUR7) purin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821663] identity=72.7; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0467100` - identity=75.2; qcov=0.839; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004639 (phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006189 ('de novo' IMP biosynthetic process); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01259 (SAICAR_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812027.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057812027.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812027.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812027.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812027.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27232565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D11
`Chr5:27233048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:27234101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:27234211`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr5:27234211`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr5:27234224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812027.1

404 aa

202

404

SAICAR_synt

PF01259 SAICAR_synt 105-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812027.1`	Pfam	`PF01259`	SAICAR_synt	Domain	105	350	1.6e-69	235.0	SAICAR synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956044.1
GAACACACACACAAAAAAAGAGAGGAGAAAAAGAAGATGGAACATTTCCTAGCCCAACCCAAGCCCATTATAACCCTACTCGCAAAAAAGAGAAAAATTATGAAATAGATTAGTATTCTAAAATCCTCCTCAAAAAAAAGATTAGTATTCTAAAAAGCGCGAATTCAGAGGGAGGGAGACAACAATGGCTCAGTCTCACTGCGTAAATTCTCCGACAACTCTCGCCGGAAAGCTCTCCCTCAGAGCAAACTCTCCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026247
ATGGCTCAGTCTCACTGCGTAAATTCTCCGACAACTCTCGCCGGAAAGCTCTCCCTCAGAGCAAACTCTCCCTCCGTGTCCCCACACTTGCTTAGAGCGTTTATCTCAAGCAAAATCACTCGCACGAAGTTTTGTTCAATGGTAATTTCTGCATCATCGTCGCCTTCTACAGTTTCTGGCGGACCCCCAAAATCGCTGTTGTTTGCCAACAGTGAACGCAAGAATGAATTGATGGATGCTATCAAAAGCTCTCTATCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812027.1
MAQSHCVNSPTTLAGKLSLRANSPSVSPHLLRAFISSKITRTKFCSMVISASSSPSTVSGGPPKSLLFANSERKNELMDAIKSSLSDCLSETHLDSAVPGLHSKTRGKVRDIYDGGDYLVLVTTDRQSAFDRVLASIPFKGQVLNETSLWWFNQTQHIIPNAIVSSPDRNVTIAKKCSVFPVEFVVRGYVTGSTDTSLWTVYQKGVRNYCGNALPDGMVKNQKLAANILTPTTKAADHDVPITPEEIIRSGLMSESDYIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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