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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002474`

染色体: Chr05 坐标: 27245716-27248886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002474`
名称	SmilChr05G002474
描述	C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27245716 - 27248886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026248`
GeneID	`131026248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026248`
原始查询	`SmilChr05G002474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310
产物	C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310
Arabidopsis	`AT1G52310` (AT1G52310) protein kinase family protein / C-type lectin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841661] identity=66.1; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0104000` (P0436E04.12-2) - identity=67.7; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00059 (Lectin_C); PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057812028.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812028.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812028.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812028.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812028.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27246594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C75
`Chr5:27246661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:27246909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:27246963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B23
`Chr5:27247250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:27247445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:27247455`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,D9
`Chr5:27247455`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A3,D9
`Chr5:27248560`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr5:27248560`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr5:27248564`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C47
`Chr5:27248564`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812028.1

551 aa

276

551

Lectin_C

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00059 Lectin_C 72-182 aa PF00069 Pkinase 268-539 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 269-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812028.1`	Pfam	`PF00059`	Lectin_C	Domain	72	182	1.1e-09	39.7	Lectin C-type domain
`XP_057812028.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	268	539	6.3e-34	118.3	Protein kinase domain
`XP_057812028.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	269	541	4.1e-39	135.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956045.1
AGGACGACTTGGACTTGGACGAGGGAAATTAACTGCACTTGTCAGAAAAATCACCAACTCCACCTTCCCACTCTACTATCTTCAATTCTCTTTAATGTTGAAACCCTAATTGCATTCCCCACCTCTTCTTCTGCACTCTTCGTCATGAATTACAGCTCGAATCGGCCGCGATTATGTCGGGTTACATATTTGTATTTTGTTCATCAACTCTAACTTGTTGGATTTTGCTTTTGATTGCCGCTGAGTCGGTTCTGAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026248
ATGGAATTCAAGCTCACAGTCCATGTACAGGCTCTCAAACTGCTGATTTATTGCCTCTTGCTTCCACTCGGAGCTTCCAACTCGGGCTTCAACGAGTCTCTTGAGGCCACTGTTATAGCCCCTTCTTCAAATCAAACTGATAGCAGAGCGCCATGCCCGTCTGGTTGGAGTATCAACCTAAGTAAGACTAAGTGTGCTAGATACAATGCAAGCAATGAATCATGGGATGAATCCGAGAAGCAGTGCACGTCTTACGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812028.1
MEFKLTVHVQALKLLIYCLLLPLGASNSGFNESLEATVIAPSSNQTDSRAPCPSGWSINLSKTKCARYNASNESWDESEKQCTSYGGHLAAATSLKELNEFQKLCNGSSNGCWIGGRFISGDWKWSDNTPYSNSSIMPTQLGCTNRSCLSSNLTGLCTLMVINGSALLMAQGCNALHASLCMLDVENKCHGMHCHEEYLIILAVVSGLIFFTTLAVVLWLLVYRRNKRRKRSRKLSNPAELALVPPSWKVFTREELKSIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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